Loss of MHC class II gene and protein expression in diffuse large B-cell lymphoma is related to decreased tumor immunosurveillance and poor patient survival regardless of other prognostic factors: a follow-up study from the Leukemia and Lymphoma Molecular Profiling Project
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The Leukemia and Lymphoma Molecular Profiling Project recently published results from DNA microarray analyses of 240 diffuse large B-cell lymphomas (DLBCLs). Four gene expression "signatures" were identified as correlated with patient outcome, including the major histocompatibility complex (MHC) class II genes (eg, HLA-DRA) which correlated with better survival. We further analyzed the effects of HLA-DRA on survival and correlated gene expression with protein status and tumor-infiltrating lymphocytes. The 5-year overall survival was 24% in the lowest 10% of HLA-DRA expression, 37% in the 10% to 25% group, 50% in the 25% to 50% group, and 55% for patients in the highest 50%. Further analysis demonstrated that the hazard ratio of death was a nonlinear function of HLA-DRA expression. Adjustment for the International Prognostic Index did not alter the impact of HLA-DRA on survival. Other MHC class II genes were found to predict survival similarly. Microarray HLA-DRA expression correlated with the presence or absence of human leukocyte antigen-DR (HLA-DR) protein in 20 of 22 cases assessed. Fewer tumor-infiltrating CD8(+) T cells were detected in MHC class II-negative cases compared with positive cases (2.8% versus 11.0%; P =.001), supporting the hypothesis that loss of tumor immunosurveillance has a devastating effect on patient outcome in DLBCL.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle