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Enregistrement W2130578918 · doi:10.1158/1055-9965.epi-03-0178

High-Throughput Detection of Glutathione <b> <i>S</i> </b>-Transferase Polymorphic Alleles in a Pediatric Cancer Population

2004· article· en· W2130578918 sur OpenAlexaff
Phillip Barnette, R. Walther Schöll, Mary Blandford, L. Ballard, Alexander Tsodikov, Jalene Magee, Susana Williams, Margaret Robertson, Francis Ali‐Osman, Richard S. Lemons, Charles Keller

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlutathione Transferases and Polymorphisms
Établissements canadiensPediatric Oncology Group
Organismes subventionnairesNIH Clinical CenterNational Center for Research ResourcesUniversity of Utah
Mots-clésGenotypingGlutathione S-transferaseBiologyAlleleMolecular biologyGenotypePopulationCancerGeneticsCancer researchGlutathioneMedicineGeneEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polymorphisms of glutathione S-transferase (GST) enzymes have been correlated with altered risk of several cancers, as well as altered response and toxicity from cancer chemotherapy. We report a low cost, highly reproducible and specific PCR-based high-throughput assay for genotyping different GSTs designed for use in large clinical trials. In comparison to an alternative genotyping method (single nucleotide extension), the sensitivity and specificity of the high throughput assay was shown to be 92 and 97%, respectively, depending on the source of genomic DNA. Using the high-throughput assay, we demonstrate by multivariate analysis an increased risk of acute lymphoblastic leukemia, glial brain tumors, and osteosarcoma for patients carrying nonnull alleles of GSTM1 and/or GSTT1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,501
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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