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Enregistrement W2130767371 · doi:10.1093/hmg/ddt104

Genome-wide association and longitudinal analyses reveal genetic loci linking pubertal height growth, pubertal timing and childhood adiposity

2013· review· en· W2130767371 sur OpenAlexafffund
Diana L. Cousminer, Diane J. Berry, Nicholas J. Timpson, Wei Ang, Elisabeth Thiering, Enda M. Byrne, H. Rob Taal, Ville Huikari, Jonathan P. Bradfield, Marjan Kerkhof, Maria M. Groen‐Blokhuis, Eskil Kreiner‐Møller, M. Marinelli, Claus Holst, Jaakko T. Leinonen, John R. B. Perry, Ida Surakka, Olli Pietiläinen, Johannes Kettunen, Verneri Anttila, Marika Kaakinen, Ulla Sovio, Anneli Pouta, Shikta Das, Vasiliki Lagou, Chris Power, Inga Prokopenko, David M. Evans, John P. Kemp, Beaté St Pourcain, Susan M. Ring, Aarno Palotie, Eero Kajantie, Clive Osmond, Terho Lehtimäki, Jorma Viikari, Mika Kähönen, Nicole M. Warrington, Stephen J. Lye, Lyle J. Palmer, Carla M. T. Tiesler, Claudia Flexeder, Grant W. Montgomery, Sarah E. Medland, Albert Hofman, Håkon Håkonarson, Mònica Guxens, Meike Bartels, Veikko Salomaa, Joanne M. Murabito, Jaakko Kaprio, Thorkild I.A. Sørensen, Ferrán Ballester, Hans Bisgaard, Dorret I. Boomsma, Gerard H. Koppelman, Struan F.A. Grant, Vincent W. V. Jaddoe, Nicholas G. Martin, Joachim Heinrich, Craig E. Pennell, Olli T. Raitakari, Johan G. Eriksson, George Davey Smith, Elina Hyppönen, Marjo‐Riitta Järvelin, Mark I. McCarthy, Samuli Ripatti, Elisabeth Widén

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2013
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBirth, Development, and Health
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer ResearchLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingNierstichtingMedical Research CouncilTurun Yliopistollinen KeskussairaalaNational Institute for Health and Care ResearchTampereen TuberkuloosisäätiöNational Health and Medical Research CouncilNovo Nordisk FondenNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesZonMwCanadian Institutes of Health ResearchNational Human Genome Research InstituteWellcome TrustNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismBritish Heart Foundation
Mots-clésBiologyGenome-wide association studyGeneticsLongitudinal dataGenetic associationAssociation (psychology)Single-nucleotide polymorphismGenotypeGeneDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The pubertal height growth spurt is a distinctive feature of childhood growth reflecting both the central onset of puberty and local growth factors. Although little is known about the underlying genetics, growth variability during puberty correlates with adult risks for hormone-dependent cancer and adverse cardiometabolic health. The only gene so far associated with pubertal height growth, LIN28B, pleiotropically influences childhood growth, puberty and cancer progression, pointing to shared underlying mechanisms. To discover genetic loci influencing pubertal height and growth and to place them in context of overall growth and maturation, we performed genome-wide association meta-analyses in 18 737 European samples utilizing longitudinally collected height measurements. We found significant associations (P < 1.67 × 10(-8)) at 10 loci, including LIN28B. Five loci associated with pubertal timing, all impacting multiple aspects of growth. In particular, a novel variant correlated with expression of MAPK3, and associated both with increased prepubertal growth and earlier menarche. Another variant near ADCY3-POMC associated with increased body mass index, reduced pubertal growth and earlier puberty. Whereas epidemiological correlations suggest that early puberty marks a pathway from rapid prepubertal growth to reduced final height and adult obesity, our study shows that individual loci associating with pubertal growth have variable longitudinal growth patterns that may differ from epidemiological observations. Overall, this study uncovers part of the complex genetic architecture linking pubertal height growth, the timing of puberty and childhood obesity and provides new information to pinpoint processes linking these traits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations226
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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