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Enregistrement W2131002525 · doi:10.1111/mpp.12190

The Top 10 oomycete pathogens in molecular plant pathology

2014· review· en· W2131002525 sur OpenAlexafffund
Sophien Kamoun, Oliver J. Furzer, Jonathan D. G. Jones, Howard S. Judelson, Gul Shad Ali, Ronaldo J. D. Dalio, Sanjoy Guha Roy, Leonardo Schena, Antonios Zambounis, Franck Panabières, David M. Cahill, Michelina Ruocco, Andreia Figueiredo, Xiao‐Ren Chen, Jon Hulvey, Remco Stam, Kurt Lamour, Mark Gijzen, Brett M. Tyler, Niklaus J. Grünwald, M. Shahid Mukhtar, Daniel Tomé, Mahmut Tör, Guido Van den Ackerveken, John M. McDowell, Fouad Daayf, William E. Fry, Hannele Lindqvist‐Kreuze, H.J.G. Meijer, Benjamin Pêtre, Jean B. Ristaino, Kentaro Yoshida, Paul R. J. Birch, Francine Govers

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant Pathology · 2014
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensUniversity of ManitobaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesWageningen University FundWageningen University and ResearchBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Institute of Food and AgricultureDirectorate for Biological SciencesAgricultural Research ServiceU.S. Forest ServiceNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaInstitut National de la Recherche AgronomiqueConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoNational Natural Science Foundation of ChinaEuropean CommissionStichting voor de Technische WetenschappenGovernment of Jiangsu ProvinceGatsby Charitable FoundationOregon Department of AgricultureNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaU.S. Department of AgricultureAgriculture and Agri-Food CanadaNational Science Foundation
Mots-clésOomycetePhytophthora ramorumBiologyPhytophthora cinnamomiPhytophthoraPhytophthora sojaePhytophthora capsiciPythium ultimumPhytophthora infestansBotanyPlasmopara viticolaDowny mildewMicrobiologyBlightBiological pest control

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oomycetes form a deep lineage of eukaryotic organisms that includes a large number of plant pathogens which threaten natural and managed ecosystems. We undertook a survey to query the community for their ranking of plant-pathogenic oomycete species based on scientific and economic importance. In total, we received 263 votes from 62 scientists in 15 countries for a total of 33 species. The Top 10 species and their ranking are: (1) Phytophthora infestans; (2, tied) Hyaloperonospora arabidopsidis; (2, tied) Phytophthora ramorum; (4) Phytophthora sojae; (5) Phytophthora capsici; (6) Plasmopara viticola; (7) Phytophthora cinnamomi; (8, tied) Phytophthora parasitica; (8, tied) Pythium ultimum; and (10) Albugo candida. This article provides an introduction to these 10 taxa and a snapshot of current research. We hope that the list will serve as a benchmark for future trends in oomycete research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations987
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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