Efflux Pump-Mediated Intrinsic Drug Resistance in <i>Mycobacterium smegmatis</i>
Notice bibliographique
Résumé
The Mycobacterium smegmatis genome contains many genes encoding putative drug efflux pumps. Yet with the exception of lfrA, it is not clear whether these genes contribute to the intrinsic drug resistance of this organism. We showed first by reverse transcription (RT)-PCR that several of these genes, including lfrA as well as the homologues of Mycobacterium tuberculosis Rv1145, Rv1146, Rv1877, Rv2846c (efpA), and Rv3065 (mmr and emrE), were expressed at detectable levels in the strain mc(2)155. Null mutants each carrying an in-frame deletion of these genes were then constructed in M. smegmatis. The deletions of the lfrA gene or mmr homologue rendered the mutant more susceptible to multiple drugs such as fluoroquinolones, ethidium bromide, and acriflavine (two- to eightfold decrease in MICs). The deletion of the efpA homologue also produced increased susceptibility to these agents but unexpectedly also resulted in decreased susceptibility to rifamycins, isoniazid, and chloramphenicol (two- to fourfold increase in MICs). Deletion of the Rv1877 homologue produced some increased susceptibility to ethidium bromide, acriflavine, and erythromycin. The upstream region of lfrA contained a gene encoding a putative TetR family transcriptional repressor, dubbed LfrR. The deletion of lfrR elevated the expression of lfrA and produced higher resistance to multiple drugs. Multidrug-resistant single-step mutants, independent of LfrA and attributed to a yet-unidentified drug efflux pump (here called LfrX), were selected in vitro and showed decreased accumulation of norfloxacin, ethidium bromide, and acriflavine in intact cells. Finally, use of isogenic beta-lactamase-deficient strains showed the contribution of LfrA and LfrX to resistance to certain beta-lactams in M. smegmatis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».