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Enregistrement W2131690391 · doi:10.1158/0008-5472.can-15-0423

WDR5 Supports an N-Myc Transcriptional Complex That Drives a Protumorigenic Gene Expression Signature in Neuroblastoma

2015· article· en· W2131690391 sur OpenAlexafffund
Yuting Sun, Jessica L. Bell, Daniel R. Carter, Samuele Gherardi, Rebecca C. Poulos, Giorgio Milazzo, Jason W.H. Wong, Rima Al‐awar, Andrew E. Tee, Pei Y. Liu, Bing Liu, Bernard Atmadibrata, Matthew Wong, Toby N. Trahair, Quan Zhao, Jason M. Shohet, Ygal Haupt, Johannes H. Schulte, Peter J. Brown, C.H. Arrowsmith, Masoud Vedadi, Karen L. MacKenzie, Stefan Hüttelmaier, Giovanni Perini, Glenn M. Marshall, Antony W. Braithwaite, Tao Liu

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreStructural Genomics ConsortiumOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesCancer Council NSWMedical Research CouncilMinistero dello Sviluppo EconomicoUniversity of New South WalesOntario Ministry of Economic Development and InnovationOntario Genomics InstituteOntario GenomicsGenome CanadaWellcome TrustGlaxoSmithKlinePfizerEli Lilly and Company
Mots-clésNeuroblastomaBiologyCancer researchPromoterHistoneMolecular biologyCarcinogenesisRNA interferenceMdm2Gene expressionRegulation of gene expressionGeneCell cultureGeneticsRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MYCN gene amplification in neuroblastoma drives a gene expression program that correlates strongly with aggressive disease. Mechanistically, trimethylation of histone H3 lysine 4 (H3K4) at target gene promoters is a strict prerequisite for this transcriptional program to be enacted. WDR5 is a histone H3K4 presenter that has been found to have an essential role in H3K4 trimethylation. For this reason, in this study, we investigated the relationship between WDR5-mediated H3K4 trimethylation and N-Myc transcriptional programs in neuroblastoma cells. N-Myc upregulated WDR5 expression in neuroblastoma cells. Gene expression analysis revealed that WDR5 target genes included those with MYC-binding elements at promoters such as MDM2. We showed that WDR5 could form a protein complex at the MDM2 promoter with N-Myc, but not p53, leading to histone H3K4 trimethylation and activation of MDM2 transcription. RNAi-mediated attenuation of WDR5 upregulated expression of wild-type but not mutant p53, an effect associated with growth inhibition and apoptosis. Similarly, a small-molecule antagonist of WDR5 reduced N-Myc/WDR5 complex formation, N-Myc target gene expression, and cell growth in neuroblastoma cells. In MYCN-transgenic mice, WDR5 was overexpressed in precancerous ganglion and neuroblastoma cells compared with normal ganglion cells. Clinically, elevated levels of WDR5 in neuroblastoma specimens were an independent predictor of poor overall survival. Overall, our results identify WDR5 as a key cofactor for N-Myc-regulated transcriptional activation and tumorigenesis and as a novel therapeutic target for MYCN-amplified neuroblastomas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,198
Tête enseignante GPT0,437
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations123
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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