MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2131813709 · doi:10.1530/jme-11-0016

Binding of activating transcription factor 6 to the A5/Core of the rat insulin II gene promoter does not mediate its transcriptional repression

2011· article· en· W2131813709 sur OpenAlexafffund
Julie Amyot, Isma Benterki, Ghislaine Fontès, Derek Hagman, Mourad Ferdaoussi, Tracy Teodoro, Allen Volchuk, Érik Joly, Vincent Poitout

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Endocrinology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité du Québec à MontréalUniversity Health NetworkCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesSan Diego State UniversityCanadian Institutes of Health ResearchCollege of Engineering, Michigan State UniversityNational Institutes of HealthMichigan State University
Mots-clésTranscription factorPromoterBiologyChromatin immunoprecipitationMolecular biologyATF6Reporter geneInsulinEndoplasmic reticulumGeneGene expressionChemistryCell biologyEndocrinologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pancreatic β-cells have a well-developed endoplasmic reticulum due to their highly specialized secretory function to produce insulin in response to glucose and nutrients. It has been previously reported that overexpression of activating transcription factor 6 (ATF6) reduces insulin gene expression in part via upregulation of small heterodimer partner. In this study, we investigated whether ATF6 directly binds to the insulin gene promoter, and whether its direct binding represses insulin gene promoter activity. A bioinformatics analysis identified a putative ATF6 binding site in the A5/Core region of the rat insulin II gene promoter. Direct binding of ATF6 was confirmed using several approaches. Electrophoretic mobility shift assays in nuclear extracts from MCF7 cells, isolated rat islets and insulin-secreting HIT-T15 cells showed ATF6 binding to the native A5/Core of the rat insulin II gene promoter. Antibody-mediated supershift analyses revealed the presence of both ATF6 isoforms, ATF6α and ATF6β, in the complex. Chromatin immunoprecipitation assays confirmed the binding of ATF6α and ATF6β to a region encompassing the A5/Core of the rat insulin II gene promoter in isolated rat islets. Overexpression of the active (cleaved) fragment of ATF6α, but not ATF6β, inhibited the activity of an insulin promoter-reporter by 50%. However, the inhibitory effect of ATF6α was insensitive to mutational inactivation or deletion of the A5/Core. Therefore, although ATF6 binds directly to the A5/Core of the rat insulin II gene promoter, this direct binding does not appear to contribute to its repressive activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,253

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Molecular EndocrinologyMême sujetPancreatic function and diabetesTravaux en français237 207