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Enregistrement W2131864272 · doi:10.1650/7464

CONSERVATION PRIORITIES FOR RESPLENDENT QUETZALS BASED ON ANALYSIS OF MITOCHONDRIAL DNA CONTROL-REGION SEQUENCES

2004· article· en· W2131864272 sur OpenAlexaff
Sofía Solórzano, Allan J. Baker, Ken Oyama

Notice bibliographique

RevueOrnithological Applications · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubspeciesMesoamericaHaplotypeThreatened speciesBiologyMitochondrial DNAGeographyEndangered speciesPopulationGenetic diversitymtDNA control regionEvolutionary biologyEcologyArchaeologyDemographyGeneticsGeneGenotypeHabitat

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Resplendent Quetzal (Pharomachrus mocinno) is a threatened bird species classified into two putative subspecies (P. m. mocinno and P. m. costaricensis) and distributed in cloud forests of seven countries in Mesoamerica. Because the birds are rare, tissue samples are difficult to obtain, but we analyzed genetic diversity in 25 quetzals from five countries based on 255 bp of domain I of the control region of mitochondrial DNA. Eight haplotypes were detected. Nucleotide diversity for Mexico (P. m. mocinno: 0.0021) and Panama (P. m. costaricensis: 0.0026) were low, and did not differ from the values estimated for other birds species irrespective of whether they were endangered. A haplotype tree rooted with the Pavonine Quetzal (P. pavoninus) recovered two reciprocally monophyletic clades corresponding to each subspecies, so we propose that each subspecies be considered as an evolutionarily significant unit for conservation planning. A minimum spanning network showed the number of genetic differences separating haplotypes within subspecies was small relative to the number of substitutions among them, indicating strong population subdivision (FST = 0.37). In spite of the limited sampling we propose that in conservation practice Mexico–Guatemala, Nicaragua, El Salvador, and Panama be considered preliminarily as independent conservation management units since they each have unique haplotypes. Additionally, these countries should construct international agreements to protect the natural vegetation corridors among cloud forests of Mesoamerica and to curtail the illegal trade of quetzals. Prioridades de Conservación para el Quetzal Basadas en el Análisis de la Región Control del ADN Mitocondrial Resumen. El quetzal (Pharomachrus mocinno) es una especie de ave amenazada clasificada en dos subespecies (P. m. mocinno y P. m. costaricensis) distribuidas en los bosques de niebla de siete países de Mesoamérica. Debido a que ésta es un ave rara, las muestras de tejido son difíciles de obtener, pero pudimos analizar la diversidad genética en 255 pb del dominio I de la región control del ADN mitocondrial en 25 quetzales procedentes de cinco países. Se encontraron ocho haplotipos. La diversidad nucleotídica para México (P. m. mocinno: 0.0021) y Panamá (P. m. costaricensis: 0.0026) fue baja, pero no difiere de la estimada para otras especies de aves amenazadas o no amenazadas. El árbol de haplotipos enraizado con P. pavoninus mostró dos clados recíprocamente monofiléticos, correspondiendo cada uno a cada subespecie, por lo que proponemos que para planes de conservación cada subespecie sea considerada como unidad evolutiva significativa independiente. Una red de distancias mínimas mostró que el número de diferencias genéticas que separa a los haplotipos dentro de las subespecies fue pequeño con respecto al número de sustituciones que existe entre ellas, indicando una fuerte división poblacional (FST = 0.37). Considerando nuestro muestreo limitado proponemos que para fines de conservación prácticos México– Guatemala, Nicaragua, El Salvador y Panamá sean considerados preliminarmente como unidades de manejo independientes ya que éstos presentan haplotipos únicos no compartidos entre localidades. Además, estos países deberían firmar acuerdos internacionales para proteger los corredores de vegetación naturales entre los bosques de niebla de Mesoamérica y tratar de reducir el comercio ilegal de los quetzales.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,552
Score d'incertitude au seuil0,313

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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