MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2132085834 · doi:10.2337/db11-0973

No Interactions Between Previously Associated 2-Hour Glucose Gene Variants and Physical Activity or BMI on 2-Hour Glucose Levels

2012· review· en· W2132085834 sur OpenAlexaff
Robert A. Scott, Audrey Y. Chu, Niels Grarup, Marie‐France Hivert, Dmitry Shungin, Anke Tönjes, Ajay Yesupriya, Daniel R. Barnes, Nabila Bouatia‐Naji, Nicole L. Glazer, Anne Jackson, Zoltán Kutalik, Vasiliki Lagou, Diana Marek, Laura J. Rasmussen‐Torvik, Heather M. Stringham, Toshiko Tanaka, Mette Aadahl, Dan E. Arking, Richard N. Bergman, Eric Boerwinkle, Lori L. Bonnycastle, Stefan R. Bornstein, Eric J. Brunner, Suzannah J. Bumpstead, Søren Brage, Olga D. Carlson, Han Chen, Yii‐Der Ida Chen, Peter S. Chines, Francis S. Collins, David Couper, Elaine Dennison, Nicole F. Dowling, Josephine Egan, Ulf Ekelund, Michael R. Erdos, Nita G. Forouhi, Caroline S. Fox, Mark O. Goodarzi, Jürgen Gräßler, Stefan Gustafsson, Göran Hallmans, Torben Hansen, Aroon D. Hingorani, John W. Holloway, Frank B. Hu, Bo Isomaa, Anthony James, Ingegerd Johansson, Anna Jonsson, Torben Jørgensen, Mika Kivimäki, Péter Kovács, Meena Kumari, Johanna Kuusisto, Markku Laakso, Cécile Lecœur, Claire Lévy‐Marchal, Guo Li, Ruth J. F. Loos, Valeri Lyssenko, Michael Marmot, Pedro Marques‐Vidal, Mario A. Morken, Gabriele Müller, Kari E. North, James S. Pankow, Felicity Payne, Inga Prokopenko, Bruce M. Psaty, Frida Renström, Kenneth Rice, Jerome I. Rotter, Denis Rybin, Camilla H. Sandholt, Avan Aihie Sayer, Peter Shrader, Peter Schwarz, David S. Siscovick, Alena Stančáková, Michael Stümvoll, Tanya M. Teslovich, Gérard Waeber, Gordon H. Williams, Daniel R. Witte, Andrew R. Wood, Weijia Xie, Michael Boehnke, Cyrus Cooper, Luigi Ferrucci, Philippe Froguel, Leif Groop, W.H. Linda Kao, Péter Vollenweider, Mark Walker, Richard M. Watanabe, Oluf Pedersen, James B. Meigs, Erik Ingelsson, Inês Barroso, José C. Florez, Paul W. Franks, Josée Dupuis, Nicholas J. Wareham, Claudia Langenberg

Notice bibliographique

RevueDiabetes · 2012
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Human Genome Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNIHR Cambridge Biomedical Research CentreSchool of Public Health, Imperial College LondonSyddansk UniversitetSamfundet FolkhälsanNovo Nordisk FondenNewcastle UniversityUniversity of OxfordWellcome TrustUniversity of Southern CaliforniaUniversity of SouthamptonKuopion Yliopistollinen SairaalaIncyteBroad InstituteCentre Hospitalier Universitaire VaudoisImperial College LondonGlaxoSmithKlineInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleCedars-Sinai Medical CenterAmerican Diabetes AssociationUniversity of WashingtonDepartment of Social Services, Australian GovernmentUmeå UniversitetMassachusetts Institute of TechnologyBritish Heart FoundationUniversity of North Carolina at Chapel HillBrigham and Women's HospitalItä-Suomen YliopistoNational Institute for Health and Care ResearchUniversity of MinnesotaMassachusetts General HospitalUniversité de LausanneKarolinska Institutet
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismSNPType 2 diabetesDiabetes mellitusInternal medicineAlleleEndocrinologyGenome-wide association studyGeneticsPolymorphism (computer science)Genetic associationGeneMedicineBiologyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gene-lifestyle interactions have been suggested to contribute to the development of type 2 diabetes. Glucose levels 2 h after a standard 75-g glucose challenge are used to diagnose diabetes and are associated with both genetic and lifestyle factors. However, whether these factors interact to determine 2-h glucose levels is unknown. We meta-analyzed single nucleotide polymorphism (SNP) × BMI and SNP × physical activity (PA) interaction regression models for five SNPs previously associated with 2-h glucose levels from up to 22 studies comprising 54,884 individuals without diabetes. PA levels were dichotomized, with individuals below the first quintile classified as inactive (20%) and the remainder as active (80%). BMI was considered a continuous trait. Inactive individuals had higher 2-h glucose levels than active individuals (β = 0.22 mmol/L [95% CI 0.13-0.31], P = 1.63 × 10(-6)). All SNPs were associated with 2-h glucose (β = 0.06-0.12 mmol/allele, P ≤ 1.53 × 10(-7)), but no significant interactions were found with PA (P > 0.18) or BMI (P ≥ 0.04). In this large study of gene-lifestyle interaction, we observed no interactions between genetic and lifestyle factors, both of which were associated with 2-h glucose. It is perhaps unlikely that top loci from genome-wide association studies will exhibit strong subgroup-specific effects, and may not, therefore, make the best candidates for the study of interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,985
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueDiabetesMême sujetGenetic Associations and EpidemiologyTravaux en français237 207