Molecular cloning and characterization of an endo-β-mannanase gene expressed in the lettuce endosperm following radicle emergence
Notice bibliographique
Résumé
Endo-β-mannanase (EC 3.2.1.78), an enzyme that mobilizes the endosperm cell walls of the lettuce (Lactuca sativa L.) seed, increases in activity in the micropylar and lateral regions of this tissue following the completion of germination. Its complementary DNA (cDNA) sequence (LsMan1) was determined using the polymerase chain reaction (PCR) with degenerate primers. The 3‘-end of the cDNA sequence was obtained by 3‘-end rapid amplification of cDNA ends (RACE), and the 5‘-end sequence by genome walking and 5‘-end RACE. The predicted amino acid sequence from the cDNA has a high identity with endo-β-mannanases present in other species (e.g. 67% identity with coffee β-1,4-mannan endohydrolase, 62% identity with tomato fruit endo-β-mannanase). Southern blot analysis suggests the presence of several members of an endo-β-mannanase gene family in the lettuce genome. Several isoforms of the enzyme, including three major ones, were detected by isoelectric focusing. Based on Northern blot analysis, accumulation of the endo-β-mannanase mRNA occurred only after lettuce seeds had germinated, and increased thereafter, although enzyme activity persisted after transcription declined.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».