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Enregistrement W2132875315 · doi:10.1128/iai.01109-06

Heptose I Glycan Substitutions on<i>Neisseria gonorrhoeae</i>Lipooligosaccharide Influence C4b-Binding Protein Binding and Serum Resistance

2007· article· en· W2132875315 sur OpenAlexaff
Sanjay Ram, Jutamas Ngampasutadol, Andrew D. Cox, Anna M. Blom, Lisa A. Lewis, Frank St. Michael, Jacek Stupak, Sunita Gulati, Peter A. Rice

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueComplement system in diseases
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyComplement systemBinding siteGlycanNeisseria gonorrhoeaeFactor HPlasma protein bindingMicrobiologyMutantAlternative complement pathwayBiochemistryGlycoproteinGeneticsGeneAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lipooligosaccharide (LOS) heptose (Hep) glycan substitutions influence gonococcal serum resistance. Several gonococcal strains bind the classical complement pathway inhibitor, C4b-binding protein (C4BP), via their porin (Por) molecule to escape complement-dependent killing by normal human serum (NHS). We show that the proximal glucose (Glc) on HepI is required for C4BP binding to Por1B-bearing gonococcal strains MS11 and 1291 but not to FA19 (Por1A). The presence of only the proximal Glc on HepI (lgtE mutant) permitted maximal C4BP binding to MS11 but not to 1291. Replacing 1291 lgtE Por with MS11 Por increased C4BP binding to levels that paralleled MS11 lgtE, suggesting that replacement of the Por1B molecule dictated the effects of HepI glycans on C4BP binding. The remainder of the strain background did not affect C4BP binding; replacing the Por of strain F62 with MS11 Por (F62 PorMS11) and truncating HepI mirrored the findings in the MS11 background. C4BP binding correlated with resistance to killing by NHS in most instances. F62 PorMS11 and its lgtE mutant were sensitive to NHS despite binding C4BP, secondary to kinetically overwhelming classical pathway activation and possibly increased alternative pathway activation (measured by factor Bb binding) by the F62 background. FA19 lgtF (HepI unsubstituted) resisted killing by only 10% NHS, not 50% NHS, despite binding levels of C4BP similar to those of FA19 and FA19 lgtE (both resistant to 50% serum), suggesting a role for the proximal Glc in serum resistance independently of C4BP binding. This study provides mechanistic insights into how HepI LOS substitutions affect the serum resistance of N. gonorrhoeae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,640
Score d'incertitude au seuil0,878

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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