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Enregistrement W2132883779 · doi:10.1074/jbc.m302946200

Cleavage of the Matricellular Protein SPARC by Matrix Metalloproteinase 3 Produces Polypeptides That Influence Angiogenesis

2003· article· en· W2132883779 sur OpenAlexaff
E. Helene Sage, May J. Reed, Sarah E. Funk, Thao Truong, Melissa Steadele, Pauli Puolakkainen, Donald H. Maurice, James A. Bassuk

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone and Dental Protein Studies
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésMatricellular proteinAngiogenesisExtracellular matrixMatrix metalloproteinaseCleavage (geology)ChemistryMolecular biologyThrombospondinCell growthCell biologyBiochemistryChorioallantoic membraneMetalloproteinaseOsteonectinDisintegrinPeptideBiologyIn vitroEnzymeCancer researchAlkaline phosphatase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SPARC, a matricellular protein that affects cellular adhesion and proliferation, is produced in remodeling tissue and in pathologies involving fibrosis and angiogenesis. In this study we have asked whether peptides generated from cleavage of SPARC in the extracellular milieu can regulate angiogenesis. Matrix metalloproteinase (MMP)-3, but not MMP-1 or 9, showed significant activity toward SPARC. Limited digestion of recombinant human (rhu)SPARC with purified catalytic domain of rhuMMP-3 produced three major fragments, which were sequenced after purification by HPLC. Three synthetic peptides (Z-1, Z-2, and Z-3) representing motifs from each fragment were tested in distinct assays of angiogenesis. Peptide Z-1 (3.9 kDa, containing a Cu2+-binding sequence KHGK) exhibited a biphasic effect on [3H]thymidine incorporation by cultured endothelial cells and stimulated vascular growth in the chick chorioallantoic membrane (CAM). In contrast, peptides Z-2 (6.1 kDa, containing Ca2+-binding EF hand-1) and Z-3 (2.2 kDa, containing neither Cu2+-binding motifs nor EF hands), inhibited cell proliferation in a concentration-dependent manner and exhibited no effects on vessel growth in the CAM. Reciprocal results were obtained in a migration assay in native collagen gels: peptide Z-1 was ineffective over a range of concentrations, whereas Z-2 or Z-3 stimulated cell migration. Therefore, proteolysis of SPARC by MMP-3 produced peptides that regulate endothelial cell proliferation and/or migration in vitro in a mutually exclusive manner. One of these peptides containing KHGK also demonstrated a concentration-dependent effect on angiogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations175
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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