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Enregistrement W2133349572 · doi:10.1002/humu.22025

Ovarian cancer susceptibility alleles and risk of ovarian cancer in<i>BRCA1</i>and<i>BRCA2</i>mutation carriers

2012· article· en· W2133349572 sur OpenAlexafffund
Susan J. Ramus, Antonis C. Antoniou, Karoline B. Kuchenbaecker, Penny Soucy, Jonathan Beesley, Xiaoqing Chen, Lesley McGuffog, Olga M. Sinilnikova, Sue Healey, Daniel Barrowdale, Andrew Lee, Mads Thomassen, Anne‐Marie Gerdes, Torben A. Kruse, Uffe Birk Jensen, Anne‐Bine Skytte, Maria A. Caligo, Annelie Liljegren, Annika Lindblom, Håkan Olsson, Ulf Kristoffersson, Marie Stenmark‐Askmalm, Beatrice Melin, Susan M. Domchek, Katherine L. Nathanson, Timothy R. Rebbeck, Anna Jakubowska, Jan Lubiński, Katarzyna Jaworska, Katarzyna Durda, Elżbieta Złowocka, Jacek Gronwald, Tomasz Huzarski, Tomasz Byrski, Cezary Cybulski, Aleksandra Tołoczko‐Grabarek, Ana Osório, Javier Benítez, M. Durán, María‐Isabel Tejada, U. Hamann, Matti A. Rookus, Flora E. van Leeuwen, Cora M. Aalfs, Hanne E.J. Meijers-Heijboer, Christi J. van Asperen, Kees E. P. van Roozendaal, J. Margriet Collée, Mieke Kriege, Rob B. van der Luijt, S. Peock, Steve D. Ellis, Radka Platte, Elena Fineberg, D. Gareth Evans, Fiona Lalloo, Chris Jacobs, Rosalind A. Eeles, Julian Adlard, Rosemarie Davidson, Diana Eccles, T Cole, Jackie Cook, J. Paterson, Fiona Douglas, Carole Brewer, Shirley Hodgson, Patrick J. Morrison, Lisa Walker, Mary Porteous, Harsh B. Pathak, Andrew K. Godwin, Dominique Stoppa-Lyonnet, Virginie Caux-Moncoutier, Antoine de Pauw, Marion Gauthier-Villars, Sylvie Mazoyer, Mélanie Léoné, Alain Calender, Christine Lasset, Valérie Bonadona, Agnès Hardouin, Pascaline Berthet, Yves-Jean Bignon, Nancy Uhrhammer, Laurence Faivre, Catherine Loustalot, Saundra S. Buys, Mary Daly, Alex Miron, Mary Beth Terry, Wendy K. Chung, Esther M. John, Melissa C. Southey, David Goldgar, Christian F. Singer, Muy-Kheng Tea, Georg Pfeiler, A. Fink-Retter, Thomas van Overeem Hansen, Bent Ejlertsen, Oskar T. Johannsson, Kenneth Offit, Tomas Kirchhoff, Mia M. Gaudet, Joseph Vijai, Mark E. Robson, Marion Piedmonte, Kelly‐Anne Phillips, Linda Van Le, James Hoffman, Amanda Ewart Toland, Marco Montagna, Silvia Tognazzo, Evgeny Imyanitov, Claudine Isaacs, Ramūnas Janavičius, Conxi Lázaro, Ignacio Blanco, Eva Tornero, Matilde Navarro, Kirsten B. Moysich, Beth Karlan, Jenny Gross, Edith Olah, Vaszko Tibor, Soo‐Hwang Teo, Patricia A. Ganz, Mary Beattie, Cecelia M. Dorfling, Elizabeth J. van Rensburg, Orland Dı́ez, Ava Kwong, Rita K. Schmutzler, Barbara Wappenschmidt, Christoph Engel, Alfons Meindl, Nina Ditsch, Norbert Arnold, Simone Heidemann, Dieter Niederacher, Sabine Preisler‐Adams, D Gadzicki, Raymonda Varon‐Mateeva, Helmut Deißler, Andrea Gehrig, Christian Sutter, Karin Kast, Britta Fiebig, Dieter Schäfer, Trinidad Caldés, Miguel de la Hoya, Heli Nevanlinna, Kristiina Aittomäki, Marie Plante, Amanda B. Spurdle, Susan L. Neuhausen, Yuan Chun Ding, Xianshu Wang, Noralane Lindor, Zachary Fredericksen, V. Shane Pankratz, Paolo Peterlongo, Siranoush Manoukian, Bernard Peissel, Daniela Zaffaroni, Bernardo Bonanni, Loris Bernard, Riccardo Dolcetti, Laura Papi, Laura Ottini, Paolo Radice, Mark H. Greene, Irene L. Andrulis, Gord Glendon, Hilmi Özçelik, Paul D.P. Pharoah, Simon A. Gayther, Jacques Simard, Douglas F. Easton, Fergus J. Couch, Georgia Chenevix‐Trench

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensCancer Care OntarioUniversity of TorontoLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCancer Center, University of KansasNational Institutes of HealthIstituto Oncologico VenetoFondazione Italiana per la Ricerca sul CancroCancer Council VictoriaDeutsche KrebshilfeSahlgrenska UniversitetssjukhusetUmeå UniversitetNational Cancer InstituteLandspítali HáskólasjúkrahúsIstituto Toscano TumoriHungarian Scientific Research FundCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, Los AngelesCancerfondenLunds UniversitetZonMwNational Breast Cancer FoundationNational Institute for Health and Care ResearchLinköpings UniversitetCanadian Breast Cancer Research AllianceRoyal Marsden NHS Foundation TrustOvarian Cancer Research FundHuntsman Cancer InstituteDeutsches KrebsforschungszentrumHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriUniversity of California, San FranciscoMinistero della SaluteAkademiska SjukhusetCancer Care OntarioCancer Research UKBeckman Research Institute, City of HopeFox Chase Cancer CenterAlleanza Contro il CancroUppsala UniversitetMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterInstituto de Salud Carlos IIIOhio State UniversityNational Health and Medical Research CouncilKansas Bioscience AuthorityUniversity of PennsylvaniaRussian Foundation for Basic ResearchGeorgetown UniversityBreast Cancer Research FoundationU.S. Department of Defense
Mots-clésOvarian cancerBiologyOdds ratioSingle-nucleotide polymorphismBreast cancerHazard ratioOncologyAlleleInternal medicinePopulationGenome-wide association studyCancerGeneticsGynecologyGenotypeMedicineConfidence intervalGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Germline mutations in BRCA1 and BRCA2 are associated with increased risks of breast and ovarian cancer. A genome-wide association study (GWAS) identified six alleles associated with risk of ovarian cancer for women in the general population. We evaluated four of these loci as potential modifiers of ovarian cancer risk for BRCA1 and BRCA2 mutation carriers. Four single-nucleotide polymorphisms (SNPs), rs10088218 (at 8q24), rs2665390 (at 3q25), rs717852 (at 2q31), and rs9303542 (at 17q21), were genotyped in 12,599 BRCA1 and 7,132 BRCA2 carriers, including 2,678 ovarian cancer cases. Associations were evaluated within a retrospective cohort approach. All four loci were associated with ovarian cancer risk in BRCA2 carriers; rs10088218 per-allele hazard ratio (HR) = 0.81 (95% CI: 0.67-0.98) P-trend = 0.033, rs2665390 HR = 1.48 (95% CI: 1.21-1.83) P-trend = 1.8 × 10(-4), rs717852 HR = 1.25 (95% CI: 1.10-1.42) P-trend = 6.6 × 10(-4), rs9303542 HR = 1.16 (95% CI: 1.02-1.33) P-trend = 0.026. Two loci were associated with ovarian cancer risk in BRCA1 carriers; rs10088218 per-allele HR = 0.89 (95% CI: 0.81-0.99) P-trend = 0.029, rs2665390 HR = 1.25 (95% CI: 1.10-1.42) P-trend = 6.1 × 10(-4). The HR estimates for the remaining loci were consistent with odds ratio estimates for the general population. The identification of multiple loci modifying ovarian cancer risk may be useful for counseling women with BRCA1 and BRCA2 mutations regarding their risk of ovarian cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,236
Score d'incertitude au seuil0,778

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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