A geographically diverse set of isolates indicates two phylogenetic lineages within<i>Stachybotrys chartarum</i>
Notice bibliographique
Résumé
Stachybotrys chartarum is a black mitosporic fungus capable of dense colonization of cellulose-based building materials such as drywall. The presence of S. chartarum in indoor environments has been reported as linked to a variety of alleged environment-related illnesses including infant acute idiopathic pulmonary hemorrhage, although there continues to be insufficient (especially exposure) data to support such associations. We investigated genetic variation among 52 morphologically and geographically diverse, indoor and outdoor isolates of S. chartarum sensu lato using molecular markers based on β-tubulin, calmodulin, elongation factor-1 alpha, and trichodiene synthase genes, as well as the internal transcribed spacer region of nuclear ribosomal DNA. Gene genealogies proved concordant in dividing all isolates into two strongly supported clades. The majority of the variable sites separating these lineages were fixed within each of these clades, and there was no evidence of recombination between genotypes. The results of this study therefore provide strong support for the recognition of two phylogenetic species within S. chartarum sensu lato, and further demonstrate the limitations of morphological characters in delineating monophyletic taxa among morphologically simple fungi.Key words: Stachybotrys atra, cryptic speciation, calmodulin, elongation factor-1 alpha, trichodiene synthase.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».