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Enregistrement W2134076623 · doi:10.1002/pro.274

Structural and functional characterization of a triple mutant form of S100A7 defective for Jab1 binding

2009· article· en· W2134076623 sur OpenAlexafffund
Nathaniel R. West, Benjamin Farnell, Jill I. Murray, Fraser Hof, Peter H. Watson, Martin J. Boulanger

Notice bibliographique

RevueProtein Science · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueS100 Proteins and Annexins
Établissements canadiensUniversity of VictoriaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BC
Mots-clésMutantMutationPlasma protein bindingBinding siteProtein structureBiophysicsChemistryWild typeDimerBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

S100A7 (psoriasin) is a calcium- and zinc-binding protein implicated in breast cancer. We have shown previously that S100A7 enhances survival mechanisms in breast cells through an interaction with c-jun activation domain binding protein 1 (Jab1), and an engineered S100A7 triple mutant (Asp(56)Gly, Leu(78)Met, and Gln(88)Lys-S100A7(3)) ablates Jab1 binding. We extend these results to include defined breast cancer cell lines and demonstrate a disrupted S100A7(3)/Jab1 phenotype is maintained. To establish the basis for the abrogated Jab1 binding, we have recombinantly produced S100A7(3), demonstrated that it retains the ability to form an exceptionally thermostable dimer, and solved the three dimensional crystal structure to 1.6 A. Despite being positioned at the dimer interface, the Leu(78)Met mutation is easily accommodated and contributes to a methionine-rich pocket formed by Met(12), Met(15), and Met(34). In addition to altering the surface charge, the Gln(88)Lys mutation results in a nearby rotameric shift in Tyr(85), leading to a substantially reorganized surface cavity and may influence zinc binding. The final mutation of Asp(56) to Gly results in the largest structural perturbation shortening helix IV by one full turn. It is noteworthy that position 56 lies in one of two divergent clusters between S100A7 and the functionally distinct yet highly homologous S100A15. The structure of S100A7(3) provides a unique perspective from which to characterize the S100A7-Jab1 interaction and better understand the distinct functions between S100A7, and it is closely related paralog S100A15.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,195

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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