<i>Agrobacterium tumefaciens</i>‐mediated transformation for targeted disruption and over expression of genes in the poplar pathogen<i><scp>S</scp>phaerulina musiva</i>
Notice bibliographique
Résumé
Summary Sphaerulina musivacauses both leaf spots and cankers on poplar. Leaf spots can lead to defoliation and cankers on branches and primary stems can lead to stem breakage and tree mortality. The recent availability of both theS. musivaandPopulus trichocarpagenomes offers a great opportunity to study host–pathogen interactions. To better understand the factors involved inS. musivapathology, we present a strategy for the transformation of this species usingAgrobacterium tumefaciens. Binary plasmids were generated with hygromycin B phosphotransferase (hph) flanked by upstream and downstream sequences of polyketide synthase‐like (PKS‐L1) gene to generate targeted gene disruptants by homologous recombination. Plasmids were also constructed for constitutive expression reporter geneseGFPandmCherry to help with histological characterization of the pathogen during infection. Gene knockouts were identified byPCRand confirmed by sequencing and Southern blotting. No significant differences were observed in melanin production betweenPKS‐L1 disruptants and wild type isolates. Colonies expressing reporter genes were identified by fluorescent stereomicroscopy. This method is a promising tool for the characterization of pathogen genes through reverse and forward genetics and for introducing markers for histopathological study.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».