Notice bibliographique
Résumé
Auteur(s) : S. Pillet Laboratoire de bacteriologie-virologie, Hopital Nord, CHU, Saint-Etienne Les virus a ARN ont la capacite de muter et de se recombiner, favorisant ainsi l’emergence de variants echappant au systeme immunitaire de l’hote infecte et aux traitements antiviraux, comme on l’observe par exemple avec le virus de l’immunodeficience humaine. Il est egalement etabli que les enterovirus sont constitues d’une mosaique de « sequences enterovirales » et les recombinaisons entre enterovirus, et plus particulierement entre souches de poliovirus « sauvages » et « vaccinales », sont tres frequentes. Les recombinaisons genetiques entre differentes souches de virus influenza, en particulier au niveau des genes codant la neuraminidase et l’hemagglutinine, permettent egalement l’emergence de nouvelles souches qui peuvent donner lieu a des epidemies, voire meme des pandemies comme celle associee a la grippe espagnole de 1918 responsable de millions de morts. La promiscuite de differents hotes (oiseaux sauvages, volaille, porc et homme) infectes par differents virus grippaux favorise le reassortiment des differents fragments du genome viral et la formation de nouveaux virus susceptibles d’infecter l’homme : les virus de la « grippe aviaire » (sous-types H5N1 et H7N7) qui circulent actuellement chez les volailles pourraient ainsi constituer une menace de pandemie si les modifications (reassortiments, recombinaisons et/ou mutations) necessaires a leur transmission efficace d’homme a homme se produisaient. Un autre virus a reussi son passage de l’animal a l’homme et a fait de nombreuses victimes au cours de l’hiver 2002-2003 : le coronavirus responsable du syndrome respiratoire aigu severe (SRAS) [1, 2]. Le reservoir de ce nouveau virus est actuellement inconnu ; cependant, il semble que les nombreux animaux vivants echanges sur les marches en Chine pourraient constituer de bons candidats. Les nombreuses etudes realisees sur ce nouveau virus ont montre qu’il ne derive pas directement de coronavirus humains ou animaux connus et pourrait donc etre classe dans un nouveau groupe taxonomique au sein des coronavirus [2]. Le sequencage et l’analyse phylogenique de plusieurs regions du genome viral par une equipe canadienne suggerent cependant que ce virus est constitue d’une mosaique de sequences nucleotidiques issues de coronavirus animaux (oiseaux et mammiferes de type felin), plus particulierement au niveau du gene S qui code la glycoproteine d’enveloppe impliquee dans la liaison du virus a la cellule hote [3]. Le coronavirus responsable du SRAS serait issu de la recombinaison entre plusieurs virus animaux ; la modification du tropisme de ce virus recombinant aurait ainsi favorise son adaptation a l’homme. L’isolement du ou des reservoirs animaux de ce nouveau virus permettra de confirmer cette hypothese. References 1. Stella Cuervo N. SARS ou pneumonie atypique severe aigue : une epidemie privilegiee du XXIe siecle. Virologie 2003 ; 7 : 222-4. 2. Vabret A. Coronavirus : une emergence reussie. Virologie 2003 ; 7 : 237-41. 3. Stavrinides J, Guttman DS. Mosaic evolution of the severe acute respiratory syndrome coronavirus. J Virol 2004 ; 78 : 76-82.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
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