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Enregistrement W2134215283 · doi:10.1093/toxsci/kfr307

Epigenetic Alterations in Sperm DNA Associated with Testicular Cancer Treatment

2011· article· en· W2134215283 sur OpenAlexafffund
Donovan Chan, Géraldine Delbès, Mylène Landry, Bernard Robaire, Jacquetta M. Trasler

Notice bibliographique

RevueToxicological Sciences · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health CentreMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchDe La Salle University
Mots-clésBiologyDNA methylationTesticular cancerEpigeneticsGerm cellMethylationSpermEpigenomeMale infertilitySpermatidGerm cell tumorsSpermatogenesisCancerBleomycinAndrologyGeneticsCancer researchInfertilityGeneChemotherapyEndocrinologyGene expressionPregnancyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNA methylation, a key component of the epigenome involved in regulating gene expression, is initially acquired in the germ line at millions of sites across the genome. Altered sperm methylation patterns are associated with infertility and transgenerational effects in humans and rodents. Testicular cancer is the most common form of cancer among men of reproductive age and has a high cure rate associated with chemotherapy treatment with bleomycin, etoposide, and cis-platinum (BEP). Although these drugs result in improved survival, they also affect the number and quality of germ cells. Our goal was to assess germ cell methylation patterns in a rodent model emulating the BEP treatment regimens used in human testicular cancer treatment. Animals were treated with control, or 0.3× (low) or 0.6× (high) dose of BEP, where a 1× dose is equivalent to human treatment regimens. Both dose-dependent and germ cell-dependent DNA methylation alterations were found at numerous loci throughout the genome. Of about 3000 loci tested, 42 loci were affected by BEP at the round spermatid stage of germ cell development, whereas 101 loci were affected in spermatozoa; 15 loci were consistently altered in spermatozoa of all high dose-treated rats. Both hyper- and hypomethylation were detected, suggesting either an interference with normal methylation patterning or abnormal repair of damaged patterns during spermatogenesis. The results indicate that a combination chemotherapy regimen used for testicular cancer treatment can result in altered DNA methylation patterns in spermatozoa and that some loci are more susceptible to damage than others.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,212
Score d'incertitude au seuil0,259

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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