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Enregistrement W2134261953 · doi:10.14740/jnr.v4i5-6.319

Key Role of Promoter Methylation and Inactivation of MCPH1 Gene in Brain Tumors

2014· article· en· W2134261953 sur OpenAlexvenueno aff
Fatemeh Karami, Firoozeh Javan, Masoud Mehrazin, Parvin Mehdipour

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurology Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMethylationMolecular biologyBrain tumorDNA methylationBisulfite sequencingGenePromoterCancer researchTelomeraseBiologyMedicineGene expressionPathologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Microcephalin (MCPH1/BIRT1) is a putative tumor suppressor gene which has recently seized great attentions in cancer studies. The present study was conducted to seek the impact of MCPH1 promoter methylation on development of brain tumors and telomere repeat length (TRL). Methods: The brain tissue section provided from brain tumor patients and two normal brain autopsies were undergone DNA isolation. DNA samples treated with bisulfite sodium using DNA modification kit (Qiagen) were amplified in methylation specific polymerization chain reaction (MSP-PCR) confirmed by sequencing. Protein expression analysis was performed by immunofluorescence (IF) assay using antibodies against MCPH1, cyclin E and CDC25A proteins. The TRL of brain tumor patients was determined through quantitative fluorescent in situ hybridization (Q-FISH). Results: The MCPH1 gene promoter was methylated in 96.6% of the patients consistent with protein expression pattern and the telomere statue was confirmed by low or absence of signal in tumor cells. Conclusion: MCPH1 promoter methylation had strong association with TRL, tumor’s grade and stage (P < 0.05). TRL was meaningfully associated with grade and subtype pathology of brain tumors (P = 0.01). Further studies are required to clarify the exact role of MCPH1 gene on TRL and tumor suppression especially in brain tumors. J Neurol Res. 2014;4(5-6):133-138 doi: http://dx.doi.org/10.14740/jnr295e

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,127
Score d'incertitude au seuil0,191

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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