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Enregistrement W2134367629 · doi:10.1128/mcb.00919-08

Acetylation of EKLF Is Essential for Epigenetic Modification and Transcriptional Activation of the β-Globin Locus

2008· article· en· W2134367629 sur OpenAlexaff
Tanushri Sengupta, Ken Chen, Éric Milot, James J. Bieker

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-Rosemont
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyChromatinLocus control regionHistoneHistone-modifying enzymesTranscription coregulatorHistone codeHistone H3Cell biologyTranscription factorTranscription (linguistics)Pioneer factorChromatin remodelingEpigeneticsAcetylationMolecular biologyGeneticsPromoterGeneGene expressionNucleosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Posttranslational modifications of transcription factors provide alternate protein interaction platforms that lead to varied downstream effects. We have investigated how the acetylation of EKLF plays a role in its ability to alter the beta-like globin locus chromatin structure and activate transcription of the adult beta-globin gene. By establishing an EKLF-null erythroid line whose closed beta-locus chromatin structure and silent beta-globin gene status can be rescued by retroviral infection of EKLF, we demonstrate the importance of EKLF acetylation at lysine 288 in the recruitment of CBP to the locus, modification of histone H3, occupancy by EKLF, opening of the chromatin structure, and transcription of adult beta-globin. We also find that EKLF helps to coordinate this process by the specific association of its zinc finger domain with the histone H3 amino terminus. Although EKLF interacts equally well with H3.1 and H3.3, we find that only H3.3 is enriched at the adult beta-globin promoter. These data emphasize the critical nature of lysine acetylation in transcription factor activity and enable us to propose a model of how modified EKLF integrates coactivators, chromatin remodelers, and nucleosomal components to alter epigenetic chromatin structure and stimulate transcription.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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