Massive and Widespread Organelle Genomic Expansion in the Green Algal Genus Dunaliella
Notice bibliographique
Résumé
The mitochondrial genomes of chlamydomonadalean green algae are renowned for their highly reduced and conserved gene repertoires, which are almost fixed at 12 genes across the entire lineage. The sizes of these genomes, however, are much more variable, with some species having small, compact mitochondrial DNAs (mtDNAs) and others having expanded ones. Earlier work demonstrated that the halophilic genus Dunaliella contains extremely inflated organelle genomes, but to date the mtDNA of only one isolate has been explored. Here, by surveying mtDNA architecture across the Chlamydomonadales, we show that various Dunaliella species have undergone massive levels of mitochondrial genomic expansion, harboring the most inflated, intron-dense mtDNAs available from chlorophyte green algae. The same also appears to be true for their plastid genomes, which are potentially among the largest of all plastid-containing eukaryotes. Genetic divergence data are used to investigate the underlying causes of such extreme organelle genomic architectures, and ultimately reveal order-of-magnitude differences in mitochondrial versus plastid mutation rates within Dunaliella.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».