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Enregistrement W2134734631 · doi:10.1096/fj.12-226498

Cytoplasmic redistribution and cleavage of AUF1 during coxsackievirus infection enhance the stability of its viral genome

2013· article· en· W2134734631 sur OpenAlexafffund
Jerry Wong, Xiaoning Si, Arkhjamil Angeles, Jingchun Zhang, Junyan Shi, Gabriel Fung, Julienne Jagdeo, Tianying Wang, Zhaohua Zhong, Eric Jan, Honglin Luo

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Immunology Research
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHeart and Stroke Foundation of British Columbia and Yukon
Mots-clésBiologyMolecular biologyUntranslated regionRNAViral replicationVirologyCleavage (geology)Gene knockdownChemistryCell biologyVirusGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Coxsackievirus B3 (CVB3) is a causative agent of viral myocarditis, hepatitis, pancreatitis, and meningitis in humans. The adenosine‐uridine (AU)‐rich element RNA binding factor 1 (AUF1) is an integral component in the regulation of gene expression. AUF1 destabilizes mRNAs and targets them for degradation by binding to AU‐rich elements in the 3′ untranslated region (UTR) of mRNAs. The 3′‐UTR of the CVB3 genome contains canonical AU‐rich sequences, raising the possibility that CVB3 RNA may also be subjected to AUF1‐mediated degradation. Here, we reported that CVB3 infection led to cytoplasmic redistribution and cleavage of AUF1. These events are independent of CVB3‐induced caspase activation but require viral protein production. Overexpression of viral protease 2A reproduced CVB3‐induced cytoplasmic redistribution of AUF1, while in vitro cleavage assay revealed that viral protease 3C contributed to AUF1 cleavage. Furthermore, we showed that knockdown of AUF1 facilitated viral RNA, protein, and progeny production, suggesting an antiviral property for AUF1 against CVB3 infection. Finally, an immunoprecipitation study demonstrated the physical interaction between AUF1 and the 3′‐UTR of CVB3, potentially targeting CVB3 genome toward degradation. Together, our results suggest that cleavage of AUF1 may be a strategy employed by CVB3 to enhance the stability of its viral genome.—Wong, J., Si, X., Angeles, A., Zhang, J., Shi, J., Fung, G., Jagdeo, J., Wang, T., Zhong, Z., Jan, E., Luo, H. Cytoplasmic redistribution and cleavage of AUF1 during coxsackievirus infection enhance the stability of its viral genome. FASEB J. 27, 2777‐2787 (2013). www.fasebj.org

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,338
Score d'incertitude au seuil0,213

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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