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Enregistrement W2135555298 · doi:10.4319/lo.2008.53.6.2533

Nitrogen and oxygen isotope fractionation during dissimilatory nitrate reduction by denitrifying bacteria

2008· article· en· W2135555298 sur OpenAlexaff
Julie Granger, Daniel M. Sigman, Moritz F. Lehmann, Philippe D. Tortell

Notice bibliographique

RevueLimnology and Oceanography · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueWastewater Treatment and Nitrogen Removal
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDenitrifying bacteriaDenitrificationNitrateNitrate reductaseChemistryIsotope fractionationPseudomonas stutzeriEnvironmental chemistryParacoccus denitrificansFractionationNitrogenBiologyBacteriaBiochemistryChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report the first measurements of coupled nitrogen (N) and oxygen (O) isotope fractionation of nitrate by laboratory cultures of denitrifying bacteria. Two seawater strains ( Pseudomonas stutzeri , Ochrobactrum sp.) and three freshwater strains ( Paracoccus denitrificans , Pseudomonas chlororaphis , Rhodobacter sphaeroides ) were examined. Among four strains of facultative anaerobic denitrifiers, N and O isotope effects were variable, ranging from 5‰ to 25‰, with evidence for a drop in the isotope effects as nitrate concentrations approached the halfsaturation constant for nitrate transport. O isotope effects were similar to their corresponding N isotope effect, such that the progressive increase in nitrate δ 18 O, when plotted against that in δ 15 N (where δ 18 O sample = [(δ 18 O: δ 16 O sample /(δ 18 O:δ 16 O) reference ‐ 1] × 1000, and δ 15 N sample × [(15N:14N) sample /(δ 15 N:δ 14 N) reference ‐ 1] × 1000), yielded slopes of 0.86 to 1.02, with a mean value of 0.96. R. sphaeroides , a photo‐heterotroph that possesses only a periplasmic (nonrespiring) dissimilatory nitrate reductase, showed less variability in nitrate N isotope effects, between 13‰ and 20‰, with a modal value of ~15‰. In contrast to the respiratory denitrifiers, R. sphaeroides consistently showed a distinct ratio of δ 18 O to δ 15 N change of ~0.62. We hypothesize that heavy N and O isotope discrimination during respiratory denitrification occurs during the intracellular reduction of nitrate by the respiratory nitrate reductase, and the observed magnitude of fractionation is likely regulated by the ratio of cellular nitrate efflux relative to uptake. The data for R. sphaeroides are consistent with isotope discrimination directly reflecting the N and O isotope effects of the periplasmic nitrate reductase NAP, without modification by nitrate uptake and efflux.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,176
Score d'incertitude au seuil0,557

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations472
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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