Nitrogen and oxygen isotope fractionation during dissimilatory nitrate reduction by denitrifying bacteria
Notice bibliographique
Résumé
We report the first measurements of coupled nitrogen (N) and oxygen (O) isotope fractionation of nitrate by laboratory cultures of denitrifying bacteria. Two seawater strains ( Pseudomonas stutzeri , Ochrobactrum sp.) and three freshwater strains ( Paracoccus denitrificans , Pseudomonas chlororaphis , Rhodobacter sphaeroides ) were examined. Among four strains of facultative anaerobic denitrifiers, N and O isotope effects were variable, ranging from 5‰ to 25‰, with evidence for a drop in the isotope effects as nitrate concentrations approached the halfsaturation constant for nitrate transport. O isotope effects were similar to their corresponding N isotope effect, such that the progressive increase in nitrate δ 18 O, when plotted against that in δ 15 N (where δ 18 O sample = [(δ 18 O: δ 16 O sample /(δ 18 O:δ 16 O) reference ‐ 1] × 1000, and δ 15 N sample × [(15N:14N) sample /(δ 15 N:δ 14 N) reference ‐ 1] × 1000), yielded slopes of 0.86 to 1.02, with a mean value of 0.96. R. sphaeroides , a photo‐heterotroph that possesses only a periplasmic (nonrespiring) dissimilatory nitrate reductase, showed less variability in nitrate N isotope effects, between 13‰ and 20‰, with a modal value of ~15‰. In contrast to the respiratory denitrifiers, R. sphaeroides consistently showed a distinct ratio of δ 18 O to δ 15 N change of ~0.62. We hypothesize that heavy N and O isotope discrimination during respiratory denitrification occurs during the intracellular reduction of nitrate by the respiratory nitrate reductase, and the observed magnitude of fractionation is likely regulated by the ratio of cellular nitrate efflux relative to uptake. The data for R. sphaeroides are consistent with isotope discrimination directly reflecting the N and O isotope effects of the periplasmic nitrate reductase NAP, without modification by nitrate uptake and efflux.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».