Gene expression modulation is associated with gene amplification, supernumerary chromosomes and chromosome loss in antimony-resistant Leishmania infantum
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Antimonials remain the first line drug against the protozoan parasite Leishmania but their efficacy is threatened by resistance. We carried out a RNA expression profiling analysis comparing an antimony-sensitive and -resistant (Sb2000.1) strain of Leishmania infantum using whole-genome 70-mer oligonucleotide microarrays. Several genes were differentially expressed between the two strains, several of which were found to be physically linked in the genome. MRPA, an ATP-binding cassette (ABC) gene known to be involved in antimony resistance, was overexpressed in the antimony-resistant mutant along with three other tandemly linked genes on chromosome 23. This four gene locus was flanked by 1.4 kb repeated sequences from which an extrachromosomal circular amplicon was generated in the resistant cells. Interestingly, gene expression modulation of entire chromosomes occurred in the antimony-resistant mutant. Southern blots analyses and comparative genomic hybridizations revealed that this was either due to the presence of supernumerary chromosomes or to the loss of one chromosome. Leishmania parasites with haploid chromosomes were viable. Changes in copy number for some of these chromosomes were confirmed in another antimony-resistant strain. Selection of a partial revertant line correlated antimomy resistance levels and the copy number of aneuploid chromosomes, suggesting a putative link between aneuploidy and drug resistance in Leishmania.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle