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Enregistrement W2135789473 · doi:10.1128/jvi.77.5.2892-2902.2003

A Single Amino Acid Substitution in Herpes Simplex Virus Type 1 VP16 Inhibits Binding to the Virion Host Shutoff Protein and Is Incompatible with Virus Growth

2003· article· en· W2135789473 sur OpenAlexaff
Jozo Knez, Patricia Bilan, John P. Capone

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésBiologyVirusComplementationMolecular biologyHerpes simplex virusMutantAmino acidVirologyGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In addition to its well-established role in the activation of herpes simplex virus immediate-early gene transcription, VP16 interacts with and downregulates the function of the virion host shutoff protein (vhs), thereby attenuating vhs-mediated destruction of viral mRNAs and translational arrest at late times of infection. We have carried out two-hybrid analysis in vivo and protein-protein interaction assays in vitro to identify determinants in VP16 necessary for interaction with vhs. The minimal amino-terminal subfragment of VP16 capable of binding to vhs encompassed residues 1 to 345. Alteration of a single leucine at position 344 to alanine (L344A) in the context of the amino-terminal fragment of VP16 containing residues 1 to 404 was sufficient to abolish interaction with vhs in vitro and in vivo. Leu344 could be replaced with hydrophobic amino acids (Ile, Phe, Met, or Val) but not by Asn, Lys, or Pro, indicating that hydrophobicity is an important property of binding to vhs. VP16 harboring a loss-of-function mutation at L344 was not compromised in its ability to interact with host cell factor (HCF-1) or to activate transcription of viral immediate-early genes in transient-transfection assays. Virus complementation assays using the VP16-null virus 8MA and the VP16/vhs double-mutant virus 8MAdeltaSma showed that VP16(L344A) was able to complement the growth of 8MAdeltaSma but not 8MA. Thus, a single point mutation in VP16 uncouples binding to vhs from other functions of VP16 required for virus growth and indicates that direct physical association between VP16 and vhs is necessary to sustain a productive infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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