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Enregistrement W2135944439 · doi:10.1073/pnas.0813310106

The role of the <i>CD58</i> locus in multiple sclerosis

2009· article· en· W2135944439 sur OpenAlexaff
Philip L. De Jager, Clare Baecher‐Allan, Lisa M. Maier, Ariel Arthur, Linda Ottoboni, Lisa F. Barcellos, Jacob L. McCauley, Stephen Sawcer, An Goris, Janna Saarela, Roman Yelensky, Alkes L. Price, Virpi Leppä, Nick Patterson, Paul I. W. de Bakker, Dong Tran, Cristin Aubin, Susan Pobywajlo, Elizabeth J. Rossin, Xinli Hu, Charles Ashley, Edwin Choy, John D. Rioux, Margaret A. Pericak‐Vance, Adrian J. Ivinson, David R. Booth, Graeme J. Stewart, Aarno Palotie, Leena Peltonen, Bénédicte Dubois, Jonathan L. Haines, Howard L. Weiner, Alastair Compston, Stephen L. Hauser, Mark J. Daly, David Reich, Jorge R. Oksenberg, David A. Hafler

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensMontreal Heart InstituteUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesU.S. Public Health ServiceNational Institutes of HealthFonds Wetenschappelijk OnderzoekVlaamse regeringEuropean CommissionMultiple Sclerosis SocietyBrigham and Women's HospitalNational Institute for Health and Care ResearchNational Multiple Sclerosis Society
Mots-clésAlleleMultiple sclerosisPeripheral blood mononuclear cellFOXP3Locus (genetics)BiologyCentral nervous systemImmunologyGeneticsGeneEndocrinologyImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multiple sclerosis (MS) is an inflammatory disease of the central nervous system associated with demyelination and axonal loss. A whole genome association scan suggested that allelic variants in the CD58 gene region, encoding the costimulatory molecule LFA-3, are associated with risk of developing MS. We now report additional genetic evidence, as well as resequencing and fine mapping of the CD58 locus in patients with MS and control subjects. These efforts identify a CD58 variant that provides further evidence of association with MS (P = 1.1 x 10(-6), OR 0.82) and the single protective effect within the CD58 locus is captured by the rs2300747(G) allele. This protective rs2300747(G) allele is associated with a dose-dependent increase in CD58 mRNA expression in lymphoblastic cell lines (P = 1.1 x 10(-10)) and in peripheral blood mononuclear cells from MS subjects (P = 0.0037). This protective effect of enhanced CD58 expression on circulating mononuclear cells in patients with MS is supported by finding that CD58 mRNA expression is higher in MS subjects during clinical remission. Functional investigations suggest a potential mechanism whereby increases in CD58 expression, mediated by the protective allele, up-regulate the expression of transcription factor FoxP3 through engagement of the CD58 receptor, CD2, leading to the enhanced function of CD4(+)CD25(high) regulatory T cells that are defective in subjects with MS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,064
Score d'incertitude au seuil0,718

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations202
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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