MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2136074629 · doi:10.1139/b00-044

An initial assessment of genetic relationships among populations of<i>Fusarium circinatum</i>in different parts of the world

2000· article· en· W2136074629 sur OpenAlexvenueno aff
Karen Wikler, Thomas R. Gordon

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésCankerBiologyGenetic diversityFungusPopulationSexual reproductionGenotypePedigree chartEvolutionary biologyBotanyGeneticsDemographyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fusarium circinatum Nirenberg &amp; O'Donnell, the fungus responsible for pitch canker disease, is a destructive pathogen of Pinus spp. Pitch canker was first described in 1946 in the southeastern United States, and since 1987 has been reported in numerous other locations including California, Mexico, Japan, and South Africa. To make a preliminary assessment of relationships between populations of F. circinatum in these different locations, we compared allele and genotype frequencies based on eight polymorphic regions of DNA from 76 isolates of the fungus. Patterns of relatedness indicate that the California and Japanese populations of the fungus share lineages with the southeastern U.S.A. population. Genetic diversity is highest in Mexico, implicating it as the center of origin for the fungus. The association of multiple vegetative compatibility groups with a common multilocus genotype suggests that vegetative compatible group diversity may be generated by mutation, rather than through recombination resulting from sexual reproduction.Key words: genomic subtraction, tree disease, genetic distance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,126
Score d'incertitude au seuil0,981

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of BotanyMême sujetPlant Pathogens and Fungal DiseasesTravaux en français237 207