Mutagenesis of ARS2 Domains To Assess Possible Roles in Cell Cycle Progression and MicroRNA and Replication-Dependent Histone mRNA Biogenesis
Notice bibliographique
Résumé
ARS2 is a regulator of RNA polymerase II transcript processing through its role in the maturation of distinct nuclear cap-binding complex (CBC)-controlled RNA families. In this study, we examined ARS2 domain function in transcript processing. Structural modeling based on the plant ARS2 orthologue, SERRATE, revealed 2 previously uncharacterized domains in mammalian ARS2: an N-terminal domain of unknown function (DUF3546), which is also present in SERRATE, and an RNA recognition motif (RRM) that is present in metazoan ARS2 but not in plants. Both the DUF3546 and zinc finger domain (ZnF) were required for association with microRNA and replication-dependent histone mRNA. Mutations in the ZnF disrupted interaction with FLASH, a key component in histone pre-mRNA processing. Mutations targeting the Mid domain implicated it in DROSHA interaction and microRNA biogenesis. The unstructured C terminus was required for interaction with the CBC protein CBP20, while the RRM was required for cell cycle progression and for binding to FLASH. Together, our results support a bridging model in which ARS2 plays a central role in RNA recognition and processing through multiple protein and RNA interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».