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Enregistrement W2136320182 · doi:10.1073/pnas.1217990109

Gating pore currents and the resting state of Na <sub>v</sub> 1.4 voltage sensor domains

2012· article· en· W2136320182 sur OpenAlexafffund
Pascal Gosselin‐Badaroudine, Lucie Delemotte, Adrien Moreau, Michael L. Klein, Mohamed Chahine

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut Universitaire en Santé Mentale de Québec
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHeart And Stroke Foundation Of QuebecNational Institutes of HealthHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésGatingHistidineBiophysicsSodium channelChemistryMembrane potentialExtracellularLysineMutantAmino acidIon channelProtonationMembraneSodiumProtonIntracellularCrystallographyIonBiochemistryBiologyPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mammalian voltage-gated sodium channels are composed of four homologous voltage sensor domains (VSDs; DI, DII, DIII, and DIV) in which their S4 segments contain a variable number of positively charged residues. We used single histidine (H) substitutions of these charged residues in the Na(v)1.4 channel to probe the positions of the S4 segments at hyperpolarized potentials. The substitutions led to the formation of gating pores that were detected as proton leak currents through the VSDs. The leak currents indicated that the mutated residues are accessible from both sides of the membrane. Leak currents of different magnitudes appeared in the DI/R1H, DII/R1H, and DIII/R2H mutants, suggesting that the resting state position of S4 varies depending on the domain. Here, DI/R1H indicates the first arginine R1, in domain DI, has been mutated to histidine. The single R1H, R2H, and R3H mutations in DIV did not produce appreciable proton currents, indicating that the VSDs had different topologies. A structural model of the resting states of the four VSDs of Na(v)1.4 relaxed in their membrane/solution environment using molecular dynamics simulations is proposed based on the recent Na(v)Ab sodium channel X-ray structure. The model shows that the hydrophobic septa that isolate the intracellular and the extracellular media within the DI, DII, and DIII VSDs are ∼2 Å long, similar to those of K(v) channels. However, the septum of DIV is longer, which prevents water molecules from hydrating the center of the VSD, thus breaking the proton conduction pathway. This structural model rationalizes the activation sequence of the different VSDs of the Na(v)1.4 channel.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,235

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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