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Enregistrement W2136354175 · doi:10.1139/z2012-040

Molecular phylogeny of<i>Gyrodactylus</i>(Monogenea) parasitizing fishes in fresh water, estuarine, and marine habitats in Canada

2012· article· en· W2136354175 sur OpenAlexaffvenueabout
Scott R. Gilmore, David K. Cone, Geoffrey J Lowe, Sue King, Simon R. M. Jones, Cathryn L. Abbott

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Zoology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueParasite Biology and Host Interactions
Établissements canadiensDalhousie UniversityFisheries and Oceans CanadaSaint Mary's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGyrodactylusMonogeneaBiologyZoologyGenusTaxonomy (biology)PhylogeneticsEcologyEvolutionary biologyFish <Actinopterygii>FisheryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gyrodactylus Nordmann, 1832 is a genus of monogenean flatworms that is well-studied in Europe and best known for the destructive pathogen of Atlantic salmon, Gyrodactylus salaris Malmberg, 1957. However, there is a paucity of information on species of Gyrodactylus occurring elsewhere despite that the genus is thought to be extremely speciose. Here we present the first major molecular phylogeny of Gyrodactylus using samples from host fishes in North America. Our aims were to characterize species and molecular diversity of North American Gyrodactylus to allow a determination of their evolutionary relationship with congenerics sampled from Europe. Specimens belonging to 25 species of Gyrodactylus and closely related species from Canada and the northern United States of America were identified using morphology and sequenced at 18S rDNA and ITS2 rDNA (totaling ca. 1430 bp). Significant molecular groups in North American Gyrodactylus were found to correspond to a major division in the genus based on the structure of the male copulatory organ. Results corroborate earlier findings suggesting that the genus Fundulotrema Kritsky and Thatcher, 1977, traditionally thought to be distinct from Gyrodactylus owing to the presence of a peduncular bar, falls within Gyrodactylus. The usefulness and application of the broadly conserved 18S primers as a standard tool for Gyrodactylus taxonomy is discussed and advocated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,045
Score d'incertitude au seuil0,588

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2012
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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