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Enregistrement W2136488776 · doi:10.1128/aem.69.11.6777-6784.2003

Binding of Pediocin PA-1 with Anionic Lipid Induces Model Membrane Destabilization

2003· article· en· W2136488776 sur OpenAlexafffund
Hélène Gaussier, Thierry Lefèvre, Muriel Subirade

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNovalaitAgriculture and Agri-Food CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsDairy Farmers of Canada
Mots-clésBacteriocinMembranePhospholipidChemistryFourier transform infrared spectroscopyInfrared spectroscopyMethyleneBiophysicsAmidePeptideCrystallographyPOPCHydrophobic effectStereochemistryOrganic chemistryChemical engineeringAntimicrobialBiochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To obtain molecular insights into the action mode of antimicrobial activity of pediocin PA-1, the interactions between this bacteriocin and dimyristoylphosphatidylcholine (DMPC) or dimyristoylphosphatidylglycerol (DMPG) model membranes have been investigated in D(2)O at pD 6 by Fourier transform infrared spectroscopy. The interactions were monitored with respect to alteration of the secondary structure of pediocin, as registered by the amide I' band, and phospholipid conformation, as revealed by the methylene nu(s)(CH(2)) and carbonyl nu(C;O) stretching vibrations. The results show that no interaction between pediocin and DMPC occurs. By contrast, pediocin undergoes a structural reorganization in the presence of DMPG. Upon heating, pediocin self-aggregates, which is not observed for this pD in aqueous solution. The gel-to-crystalline phase transition of DMPG shifts to higher temperatures with a concomitant dehydration of the interfacial region. Our results indicate that pediocin is an extrinsic peptide and that its action mechanism may lie in a destabilization of the cell membrane.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,160
Écart entre enseignants0,152 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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