Synthesis of an Agonistic, Difluoro-Azido Photolabel of Angiotensin II and Labeling of the AT<sub>1</sub>Receptor: Transmembrane Domains 3, 6, and 7 Form the Ligand-Binding Pocket
Notice bibliographique
Résumé
p-Azido-phenylalanine has been frequently used for photoaffinity labeling of target proteins such as the angiotensin receptors. However, chemical studies showed that simple aryl nitrenes first react intramolecularly, forming a semistable cyclic keteneimine and then reacting with nucleophile residues in the target structure like those of lysine and arginine. We synthesized 3,5-difluoro-4-azidophenylalanine where the formation of the keteneimine is prevented and where photoincorporation should be due to nonselective nitrene insertion only. This new amino acid was introduced in position 8 of angiotensin II and compared with the corresponding azidophenylalanine peptide using human AT1 receptor as target. The new photolabel maintained full agonist activity and a similar yield of photolabeling but without the previously observed gradual hydrolysis. Several selective proteolyses of the labeled receptor indicate that the new photolabel forms three simultaneous contact regions on the hAT1 receptor, suggestive of a nonselective behavior of the photolabel. A major contact was established in the sixth transmembrane domain but also in the third and seventh domain. Our results are in excellent agreement with those recently obtained from methionine proximity assay studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».