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Enregistrement W2137696823 · doi:10.1371/journal.pgen.1002745

WNT16 Influences Bone Mineral Density, Cortical Bone Thickness, Bone Strength, and Osteoporotic Fracture Risk

2012· review· en· W2137696823 sur OpenAlexafffund
Hou‐Feng Zheng, Jonathan H. Tobias, Emma L. Duncan, David M. Evans, Joel Eriksson, Lavinia Paternoster, Laura M. Yerges-Armstrong, Terho Lehtimäki, Ulrica Bergström, Mika Kähönen, Paul Leo, Olli T. Raitakari, Marika Laaksonen, Geoffrey C. Nicholson, Jorma Viikari, Leo‐Pekka Lyytikäinen, Carolina Medina‐Gómez, Fernando Rivadeneira, Richard L. Prince, Harri Sievänen, William D. Leslie, Dan Mellström, John A. Eisman, Sofia Movérare‐Skrtic, David Goltzman, David A. Hanley, Graeme Jones, Beaté St Pourcain, Yongjun Xiao, Nicholas J. Timpson, George Davey Smith, Ian R. Reid, Susan M. Ring, Philip N. Sambrook, Magnus K. Karlsson, Elaine Dennison, John P. Kemp, Patrick Danoy, Adrian Sayers, Scott G. Wilson, Maria Nethander, Eugène McCloskey, Liesbeth Vandenput, Richard Eastell, Jeff Liu, Tim D. Spector, Braxton D. Mitchell, Elizabeth A. Streeten, Robert Brommage, U. Pettersson, Matthew A. Brown, Claes Ohlsson, J. Brent Richards, Mattias Lorentzon

Notice bibliographique

RevuePLoS Genetics · 2012
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone health and osteoporosis research
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of ManitobaMontreal Heart InstituteMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNovo Nordisk FondenTurun Yliopistollinen KeskussairaalaSvenska LäkaresällskapetNational Health and Medical Research CouncilEmil Aaltosen SäätiöVetenskapsrådetSuomen KulttuurirahastoStiftelsen för Strategisk ForskningJuho Vainion SäätiöUniversity of BristolAustralian Cancer Research FoundationTampereen TuberkuloosisäätiöKelaNovo NordiskPaavo Nurmen SäätiöJewish General HospitalKing's College LondonDairy Farmers of CanadaAcademy of FinlandChronic Disease Research FoundationNational Institute on AgingNational Institute for Health and Care ResearchEuropean CommissionKempe FoundationWellcome Trust
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismGenome-wide association studySNPBone mineralBone densityInternal medicineBiologyGenetic associationAlleleOsteoporosisGeneticsEndocrinologyMedicineGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We aimed to identify genetic variants associated with cortical bone thickness (CBT) and bone mineral density (BMD) by performing two separate genome-wide association study (GWAS) meta-analyses for CBT in 3 cohorts comprising 5,878 European subjects and for BMD in 5 cohorts comprising 5,672 individuals. We then assessed selected single-nucleotide polymorphisms (SNPs) for osteoporotic fracture in 2,023 cases and 3,740 controls. Association with CBT and forearm BMD was tested for ∼2.5 million SNPs in each cohort separately, and results were meta-analyzed using fixed effect meta-analysis. We identified a missense SNP (Thr>Ile; rs2707466) located in the WNT16 gene (7q31), associated with CBT (effect size of -0.11 standard deviations [SD] per C allele, P = 6.2 × 10(-9)). This SNP, as well as another nonsynonymous SNP rs2908004 (Gly>Arg), also had genome-wide significant association with forearm BMD (-0.14 SD per C allele, P = 2.3 × 10(-12), and -0.16 SD per G allele, P = 1.2 × 10(-15), respectively). Four genome-wide significant SNPs arising from BMD meta-analysis were tested for association with forearm fracture. SNP rs7776725 in FAM3C, a gene adjacent to WNT16, was associated with a genome-wide significant increased risk of forearm fracture (OR = 1.33, P = 7.3 × 10(-9)), with genome-wide suggestive signals from the two missense variants in WNT16 (rs2908004: OR = 1.22, P = 4.9 × 10(-6) and rs2707466: OR = 1.22, P = 7.2 × 10(-6)). We next generated a homozygous mouse with targeted disruption of Wnt16. Female Wnt16(-/-) mice had 27% (P<0.001) thinner cortical bones at the femur midshaft, and bone strength measures were reduced between 43%-61% (6.5 × 10(-13)<P<5.9 × 10(-4)) at both femur and tibia, compared with their wild-type littermates. Natural variation in humans and targeted disruption in mice demonstrate that WNT16 is an important determinant of CBT, BMD, bone strength, and risk of fracture.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations295
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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