Photo-control of peptide helix content by an azobenzene cross-linker: steric interactions with underlying residues are not critical
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Notice bibliographique
Résumé
Photo-control of protein conformation could prove useful for probing function in diverse biological systems. Recently, we reported photo-switching of helix content in a short peptide containing an azobenzene cross-linker between cysteine residues at positions i and i + 7 in the sequence. In the original sequence, underlying residues at positions i + 3 and i + 4 were made bulky as preliminary modelling suggested that this would enhance photo-control of helix content. To test this hypothesis, peptides with Val, Aib; Ile, Aib; and Ala, Ala at positions i + 3 and i + 4 were synthesized, cross-linked and characterized. Before cross-linking, the peptides show distinct conformational behaviours: two with differing helix/coil mixtures whereas the other has a circular dichroism (CD) spectrum characteristic of beta-sheet and a tendency to aggregate. However, upon cross-linking the peptides have very similar CD spectra: predominantly random coil in the dark but predominantly helical upon irradiation. These results refute the original hypothesis. Steric interactions between the linker and underlying residues do not appear to be critical for photo-switching behaviour. When the cross-linking bridge is lengthened by replacing the i, i + 7 cysteine residues with homocysteine, a lower degree of photo-control of helicity is observed. Furthermore, a non-cross-linking version of the azobenzene reagent is shown not to produce any photo-control of helicity. We conclude that the intramolecular cross-link is essential for photo-switching and that it should be applicable to a wide range of peptides and proteins.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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