Cisplatin-DNA Adducts by Vibrational Circular Dichroism Spectroscopy: Structure and Isomerization of d(CCTG*G*TCC)·d(GGACCAGG) Intrastrand Cross-Linked by Cisplatin
Notice bibliographique
Résumé
The intrastrand cisplatin adduct of the duplex d(CCTG*G*TCC)·d(GGACCAGG), where the asterisks denote the 1,2-intrastrand crosslink, was synthesized and studied in solution in D 2 O by vibrational circular dichroism (VCD) and infrared absorption spectroscopy. Comparison of the spectra of the platinated and unmodified complexes confirmed that the entire structure is considerably distorted, as a result of the platinum coordination to the octamer duplex. The major changes in the VCD spectra were detected in the fourth base step, where the cisplatin cross-links the adjacent guanine bases G4 and G5. Platinum coordination shifts the G4−C13 and G5−C12 base pairs apart, with a concomitant disruption of the stacking between the neighboring bases T3−G4 and G5−T6. The resultant new VCD couplets were assigned to stacking interactions between A11 and A14, which implies a substantially distorted structure. Slow isomerization is indicated by diagnostic changes in VCD, converting the intra strand adduct to other adducts. The corresponding absorption spectra remain essentially unchanged. This DNA octamer was previously studied by NMR in great detail when the isomerization was first detected after one day. Our measurements show that the conversion began soon after both strands were annealed and the first signs were detected in 2 h. This investigation again demonstrated convincingly that VCD is very sensitive to DNA structure modified by complex formation with cisplatin and may become more widely applicable for other similar applications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».