MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2138580291 · doi:10.1053/j.gastro.2005.12.032

Bile Acids Induce Ectopic Expression of Intestinal Guanylyl Cyclase C Through Nuclear Factor-κB and Cdx2 in Human Esophageal Cells

2006· article· en· W2138580291 sur OpenAlexaff
Philip R. Debruyne, Matthew E. Witek, Li Gong, Ruth Birbe, Inna Chervoneva, Tianru Jin, Claire Domon–Cell, Juan P. Palazzo, Jean‐Noël Freund, Peng Li, Giovanni M. Pitari, Stephanie Schulz, Scott A. Waldman

Notice bibliographique

RevueGastroenterology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of HealthBelgian American Educational Foundation
Mots-clésCDX2Ectopic expressionSoluble guanylyl cyclaseChemistryGuanylate cyclase 2CGUCY2DGuanylate cyclaseCancer researchInternal medicineCell biologyEndocrinologyBiochemistryMedicineBiologyTranscription factorReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND & AIMS: Although progression to adenocarcinoma at the gastroesophageal junction reflects exposure to acid and bile acids associated with reflux, mechanisms mediating this transformation remain undefined. Guanylyl cyclase C (GC-C), an intestine-specific tumor suppressor, may represent a mechanism-based marker and target of transformation at the gastroesophageal junction. The present studies examine the expression of GC-C in normal tissues and tumors from esophagus and stomach and mechanisms regulating its expression by acid and bile acids. METHODS: Gene expression was examined by reverse-transcription polymerase chain reaction, promoter analysis, immunohistochemistry, immunoblotting, and functional analysis. Promoter transactivation was quantified by using luciferase constructs and mutational analysis. DNA binding of transcription factors was examined by electromobility shift analysis. RESULTS: GC-C mRNA and protein were ectopically expressed in approximately 80% of adenocarcinomas arising in, but not in normal, esophagus and stomach. Similarly, in OE19 human esophageal cancer cells, deoxycholate and acid induced expression of GC-C. This was associated with the induction of expression of Cdx2, a transcription factor required for GC-C expression. In turn, induction of Cdx2 expression by deoxycholate was mediated by binding sites in the proximal promoter for nuclear factor kappaB (NF-kappaB). Furthermore, deoxycholate increased NF-kappaB activity, associated with nuclear translocation and Cdx2 promoter binding of the NF-kappaB subunit p50. Moreover, a dominant negative construct for NF-kappaB prevented deoxycholate-induced p50 nuclear translocation and activation of the Cdx2 promoter. CONCLUSIONS: Transformation associated with reflux at the gastroesophageal junction reflects activation by bile acid and acid of a transcriptional program involving NF-kappaB and Cdx2, which mediate intestinal metaplasia and ectopic expression of GC-C.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations91
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGastroenterologyMême sujetDigestive system and related healthTravaux en français237 207