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Enregistrement W2138733479 · doi:10.1158/1055-9965.epi-11-0775

Pathology of Breast and Ovarian Cancers among <i>BRCA1</i> and <i>BRCA2</i> Mutation Carriers: Results from the Consortium of Investigators of Modifiers of <i>BRCA1</i> / <i>2</i> (CIMBA)

2012· article· en· W2138733479 sur OpenAlexafffund
Nasim Mavaddat, Daniel Barrowdale, Irene L. Andrulis, Susan M. Domchek, Diana Eccles, Heli Nevanlinna, Susan J. Ramus, Amanda B. Spurdle, Mark E. Robson, Mark E. Sherman, Anna Marie Mulligan, Fergus J. Couch, Christoph Engel, Lesley McGuffog, Sue Healey, Olga M. Sinilnikova, Melissa C. Southey, Mary Beth Terry, David E. Goldgar, Frances P. O’Malley, Esther M. John, Ramūnas Janavičius, Laima Tihomirova, Thomas van Overeem Hansen, Finn C. Nielsen, Ana Osório, Alexandra Stavropoulou, Javier Benı́tez, Siranoush Manoukian, Bernard Peissel, Monica Barile, Sara Volorio, Barbara Pasini, Riccardo Dolcetti, Anna Laura Putignano, Laura Ottini, Paolo Radice, Ute Hamann, Muhammad Usman Rashid, Frans B.L. Hogervorst, Mieke Kriege, Rob B. van der Luijt, Susan Peock, Debra Frost, D. Gareth Evans, Carole Brewer, Lisa Walker, Mark T. Rogers, Lucy Side, Catherine Houghton, JoEllen Weaver, Andrew K. Godwin, Rita K. Schmutzler, Barbara Wappenschmidt, Alfons Meindl, Karin Kast, Norbert Arnold, Dieter Niederacher, Christian Sutter, Helmut Deißler, Doroteha Gadzicki, Sabine Preisler‐Adams, Raymonda Varon-Mateeva, Ines Schönbuchner, Heidrun Gevensleben, Dominique Stoppa‐Lyonnet, Muriel Belotti, Laure Barjhoux, Claudine Isaacs, Beth N. Peshkin, Trinidad Caldés, Miguel de la Hoya, Carmen Cañadas, Tuomas Heikkinen, Päivi Heikkilä, Kristiina Aittomäki, Ignacio Blanco, Conxi Lázaro, Joan Brunet, Bjarni A. Agnarsson, Aðalgeir Arason, Rósa B. Barkardóttir, Martine Dumont, Jacques Simard, Marco Montagna, Simona Agata, Emma D’Andrea, Max Yan, Stephen B. Fox, Timothy R. Rebbeck, Wendy S. Rubinstein, Nadine Tung, Judy E. Garber, Xianshu Wang, Zachary Fredericksen, V. Shane Pankratz, Noralane M. Lindor, Csilla I. Szabo, Kenneth Offit, Rita A. Sakr, Mia M. Gaudet, Christian F. Singer, Muy‐Kheng M. Tea, Christine Rappaport, Mark H. Greene, Anna P. Sokolenko, Evgeny Imyanitov, Amanda E. Toland, Leigha Senter, Kevin Sweet, Mads Thomassen, Anne‐Marie Gerdes, Torben A. Kruse, Maria A. Caligo, Paolo Aretini, Johanna Rantala, Anna von Wachenfeld, Karin Henriksson, Linda Steele, Susan L. Neuhausen, Robert L. Nussbaum, Mary Beattie, Kunle Odunsi, Lara Sucheston, Simon A. Gayther, Jenny Gross, Christine Walsh, Beth Y. Karlan, Georgia Chenevix‐Trench, Douglas F. Easton, Antonis C. Antoniou

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute for Health and Care ResearchCanadian Institutes of Health ResearchNational Cancer InstituteCancer Research UKNational Institutes of HealthZonMw
Mots-clésMedicineOvarian cancerMutationOncologyGynecologyInternal medicineBreast cancerPathologyBiologyGeneticsCancerGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Previously, small studies have found that BRCA1 and BRCA2 breast tumors differ in their pathology. Analysis of larger datasets of mutation carriers should allow further tumor characterization. METHODS: We used data from 4,325 BRCA1 and 2,568 BRCA2 mutation carriers to analyze the pathology of invasive breast, ovarian, and contralateral breast cancers. RESULTS: There was strong evidence that the proportion of estrogen receptor (ER)-negative breast tumors decreased with age at diagnosis among BRCA1 (P-trend = 1.2 × 10(-5)), but increased with age at diagnosis among BRCA2, carriers (P-trend = 6.8 × 10(-6)). The proportion of triple-negative tumors decreased with age at diagnosis in BRCA1 carriers but increased with age at diagnosis of BRCA2 carriers. In both BRCA1 and BRCA2 carriers, ER-negative tumors were of higher histologic grade than ER-positive tumors (grade 3 vs. grade 1; P = 1.2 × 10(-13) for BRCA1 and P = 0.001 for BRCA2). ER and progesterone receptor (PR) expression were independently associated with mutation carrier status [ER-positive odds ratio (OR) for BRCA2 = 9.4, 95% CI: 7.0-12.6 and PR-positive OR = 1.7, 95% CI: 1.3-2.3, under joint analysis]. Lobular tumors were more likely to be BRCA2-related (OR for BRCA2 = 3.3, 95% CI: 2.4-4.4; P = 4.4 × 10(-14)), and medullary tumors BRCA1-related (OR for BRCA2 = 0.25, 95% CI: 0.18-0.35; P = 2.3 × 10(-15)). ER-status of the first breast cancer was predictive of ER-status of asynchronous contralateral breast cancer (P = 0.0004 for BRCA1; P = 0.002 for BRCA2). There were no significant differences in ovarian cancer morphology between BRCA1 and BRCA2 carriers (serous: 67%; mucinous: 1%; endometrioid: 12%; clear-cell: 2%). CONCLUSIONS/IMPACT: Pathologic characteristics of BRCA1 and BRCA2 tumors may be useful for improving risk-prediction algorithms and informing clinical strategies for screening and prophylaxis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations668
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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