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Enregistrement W2139159095 · doi:10.1073/pnas.1203149109

Homeodomain POU and Abd-A proteins regulate the transcription of pupal genes during metamorphosis of the silkworm, <i>Bombyx mori</i>

2012· article· en· W2139159095 sur OpenAlexfundno aff
Huimin Deng, Jialing Zhang, Yong Li, Sichun Zheng, Lin Liu, Wei‐Hua Xu, Subba Reddy Palli, Qili Feng

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Forest ServiceNational Key Research and Development Program of ChinaJohns Hopkins Bloomberg School of Public HealthJohns Hopkins UniversityU.S. Forest ServiceChinese Academy of SciencesNational High-tech Research and Development Program
Mots-clésBiologyBombyx moriHomeoboxMetamorphosisTranscription factorPOU domainBombyxRNA interferenceCell biologyMolecular biologyGene expressionGeneElectrophoretic mobility shift assayTranscription (linguistics)RNAGeneticsLarvaBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A cascade of 20-hydroxyecdysone-mediated gene expression and repression initiates larva-to-pupa metamorphosis. We recently showed that two transcription factors, BmPOUM2 and BmβFTZ-F1, bind to the cis-regulatory elements in the promoter of the gene coding for cuticle protein, BmWCP4, and regulate its expression during Bombyx mori metamorphosis. Here we show that down-regulation of BmPOUM2 expression by RNA interference during the wandering stage resulted in failure to complete metamorphosis. The thorax epidermis of RNA interference-treated larvae became transparent, wing disc growth and differentiation were arrested, and the larvae failed to spin cocoons. Quantitative real-time PCR analysis showed that expression of the genes coding for pupal-specific wing cuticle proteins BmWCP1, BmWCP2, BmWCP3, BmWCP4, BmWCP5, BmWCP6, BmWCP8, and BmWCP9 were down-regulated in BmPOUM2 dsRNA-treated animals, whereas overexpression of BmPOUM2 protein increased the expression of BmWCP4, BmWCP5, BmWCP6, BmWCP7, and BmWCP8. Pull-down assays, far-Western blot, and electrophoretic mobility shift assay showed that the BmPOUM2 protein interacted with another homeodomain transcription factor, BmAbd-A, to induce the expression of BmWCP4. Immunohistochemical localization of BmPOUM2, BmAbd-A, and BmWCP4 proteins revealed that BmAbd-A and BmPOUM2 proteins are colocalized in the wing disc cell nuclei, whereas BmWCP4 protein is localized in the cytoplasm. Together these data suggest that BmPOUM2 interacts with the homeodomain transcription factor BmAbd-A and regulates the expression of BmWCP4 and probably other BmWCPs to complete the larva-to-pupa transformation. Although homeodomain proteins are known to regulate embryonic development, this study showed that these proteins also regulate metamorphosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,254
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,004
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations64
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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