MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2139195068 · doi:10.1089/hum.2005.16.1241

Silencing and Variegation of Gammaretrovirus and Lentivirus Vectors

2005· review· en· W2139195068 sur OpenAlexafffund
James Ellis

Notice bibliographique

RevueHuman Gene Therapy · 2005
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoSickKids Foundation
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésGammaretrovirusGene silencingRetrovirusLentivirusProvirusBiologyVector (molecular biology)RNA interferenceViral vectorVirologyGeneticsGeneVirusGenomeRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Retrovirus vectors integrate into the genome, providing stable gene transfer, but integration contributes in part to transcriptional silencing that compromises long-term expression. In the case of gammaretrovirus vectors based on murine leukemia virus, many integration events are completely silenced in undifferentiated stem cells and in transgenic mice. Gammaretrovirus vectors are also subject to variegation in which sister cells bearing the same provirus differentially express, and cell differentiation can lead to extinction of vector expression. In contrast, lentivirus vectors based on human immunodeficiency virus type 1 appear to express more efficiently, although other reports indicate that lentivirus vectors can be silenced. This review summarizes the key features of gammaretrovirus vector silencing. The evidence for and against gene silencing of lentivirus vectors is described with special emphasis on the potential effects of vector design, provirus copy number, and integration site preferences on silencing. This analysis suggests that the difference between selfinactivating (SIN) lentivirus vectors and their modified SIN gammaretrovirus counterparts may be less dramatic than previously thought. It will therefore be important to further characterize the mechanisms of silencing, in order to create better gammaretrovirus and lentivirus vectors that consistently express at single copy for gene therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations382
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHuman Gene TherapyMême sujetVirus-based gene therapy researchTravaux en français237 207