MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2139820393 · doi:10.1093/protein/gzp038

Immunological mimicry of PrPC-PrPSc interactions: antibody-induced PrP misfolding

2009· article· en· W2139820393 sur OpenAlexafffund
Li Li, William Guest, Ailong Huang, Steven S. Plotkin, Neil R. Cashman

Notice bibliographique

RevueProtein Engineering Design and Selection · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of British Columbia Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BCGovernment of CanadaAlfred P. Sloan Foundation
Mots-clésEpitopeGene isoformMonoclonal antibodyChemistryScrapiePrion proteinCell biologyProteaseAntibodyMolecular mimicryConformational changePeptideBiochemistryBiologyEnzymeImmunologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prion diseases are associated with the conversion of cellular prion protein (PrP(C)) to an abnormal protease-resistant conformational isoform (PrP(Sc)) by template-directed conversion. The interaction between PrP(C) and PrP(Sc) is mediated by specific sites which have been mapped to six putative 'binding and conversion domains' (PrP-BCD) through peptide and antibody competition studies. Monoclonal antibodies (mAbs) directed against the bityrosine motif Tyr-Tyr-Arg (YYR) specifically recognize PrP(Sc) and other misfolded PrP species. Here, we report that select bead-bound PrP-BCD mAbs induce exposure of bityrosine epitopes on mouse brain PrP. By competition immunoprecipitation, we show that PrP-BCD mAb-induced bityrosine exposure occurs at alpha-helices 1 and 3. However, PrP-BCD mAb-induced PrP(C) misfolding is not accompanied by beta-sheet dissociation, a key event in PrP(C) conversion to PrP(Sc), and is not associated with acquisition of protease resistance, or the capacity to recruit additional molecules of PrP. Our data suggest that mAb mimics of the physical interaction of PrP(C) with PrP(Sc) can induce unfolding of specific PrP domains, but that subsequent processes (including the energetically unfavorable beta-sheet dissociation) effect isoform conversion in prion disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueProtein Engineering Design and SelectionMême sujetPrion Diseases and Protein MisfoldingTravaux en français237 207