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Enregistrement W2139852129 · doi:10.1093/infdis/jis933

Abrupt Emergence of a Single Dominant Multidrug-Resistant Strain of Escherichia coli

2013· article· en· W2139852129 sur OpenAlex
James R. Johnson, Veronika Tchesnokova, Brian Johnston, Connie Clabots, Pacita L. Roberts, Mariya Billig, Kim Riddell, Peggy Rogers, Xuan Qin, Susan M. Butler‐Wu, Lance B. Price, Maliha Aziz, Marie–Hélène Nicolas–Chanoine, Chitrita DebRoy, Ari Robicsek, Glen Hansen, Carl Urban, Joanne L. Platell, Darren J. Trott, George G. Zhanel, Scott J. Weissman, Brad T. Cookson, Ferric C. Fang, Ajit P. Limaye, Delia Scholes, Sujay Chattopadhyay, David C. Hooper, Evgeni V. Sokurenko

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésEscherichia coliMultiple drug resistanceMicrobiologyStrain (injury)BiologyVirologyGeneticsDrug resistanceGeneAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Fluoroquinolone-resistant Escherichia coli are increasingly prevalent. Their clonal origins--potentially critical for control efforts--remain undefined. METHODS: Antimicrobial resistance profiles and fine clonal structure were determined for 236 diverse-source historical (1967-2009) E. coli isolates representing sequence type ST131 and 853 recent (2010-2011) consecutive E. coli isolates from 5 clinical laboratories in Seattle, Washington, and Minneapolis, Minnesota. Clonal structure was resolved based on fimH sequence (fimbrial adhesin gene: H subclone assignments), multilocus sequence typing, gyrA and parC sequence (fluoroquinolone resistance-determining loci), and pulsed-field gel electrophoresis. RESULTS: Of the recent fluoroquinolone-resistant clinical isolates, 52% represented a single ST131 subclonal lineage, H30, which expanded abruptly after 2000. This subclone had a unique and conserved gyrA/parC allele combination, supporting its tight clonality. Unlike other ST131 subclones, H30 was significantly associated with fluoroquinolone resistance and was the most prevalent subclone among current E. coli clinical isolates, overall (10.4%) and within every resistance category (11%-52%). CONCLUSIONS: Most current fluoroquinolone-resistant E. coli clinical isolates, and the largest share of multidrug-resistant isolates, represent a highly clonal subgroup that likely originated from a single rapidly expanded and disseminated ST131 strain. Focused attention to this strain will be required to control the fluoroquinolone and multidrug-resistant E. coli epidemic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,291
Score d'incertitude au seuil0,336

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle