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Enregistrement W2140042864 · doi:10.1128/iai.68.5.2493-2502.2000

RpmA Is Required for Nonopsonic Phagocytosis of <i>Pseudomonas aeruginosa</i>

2000· article· en· W2140042864 sur OpenAlexafffund
David Simpson, David P. Speert

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilMedical Research Council Canada
Mots-clésPhagocytosisBiologyMicrobiologyPseudomonas aeruginosaMutantTransposable elementGeneMolecular biologyBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas aeruginosa causes severe respiratory tract infections in patients with cystic fibrosis (CF). We have been examining nonopsonic phagocytosis of P. aeruginosa by macrophages. To study the P. aeruginosa-macrophage interaction at the molecular level, we have constructed a transposon Tn5G bank in a clinical isolate of P. aeruginosa (strain 4020) and identified mutants resistant to nonopsonic phagocytosis. Phagocytosis-resistant mutants were enriched by passaging the transposon bank over 18 macrophage monolayers. Of 900 individual mutants isolated from this enriched pool in a nonopsonic phagocytosis assay, we identified 85 putative mutants that were resistant to phagocytosis. In this study, we have characterized one of these transposon mutants, P. aeruginosa 4020 H27A, which was poorly ingested. H27A possessed a Tn5G insertion in a gene encoding a protein with homology to the MotA proteins of several species of bacteria. We have called this gene rpmA for required for phagocytosis by macrophages. RpmA is one of two MotA paralogs in P. aeruginosa. This rpmA::Tn5G mutant was motile both on agar plates and in visual examination of wet mounts. The phagocytosis defect was partially complemented by providing the rpmA gene in trans and fully complemented when both rpmA and rpmB were provided. A rpmA null mutant was ingested by macrophages similar to the H27A transposon mutant. These data suggest that the rpmA and rpmB gene products are required for the efficient ingestion of P. aeruginosa by macrophages.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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