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Enregistrement W2140258750 · doi:10.1128/jvi.00179-11

Strong Human Endogenous Retrovirus-Specific T Cell Responses Are Associated with Control of HIV-1 in Chronic Infection

2011· article· en· W2140258750 sur OpenAlexaff
Devi SenGupta, Ravi Tandon, Raphaella G. S. Vieira, Lishomwa C. Ndhlovu, Rachel Lown-Hecht, Christopher E. Ormsby, Liyen Loh, R. Brad Jones, Keith Garrison, Jeffrey N. Martin, Vanessa A. York, Gerald Spotts, Gustavo Reyes‐Terán, Mario Ostrowski, Frederick Hecht, Steven G. Deeks, Douglas F. Nixon

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesFogarty International CenterUniversity of California, San FranciscoCenter for AIDS Research, University of WashingtonNational Institutes of HealthConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaRagon Institute of MGH, MIT and HarvardNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesPfizer
Mots-clésBiologyELISPOTImmunologyViremiaViral loadVirologyT cellPeripheral blood mononuclear cellCD8EpitopeImmune systemAntibodyVirusIn vitroGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eight percent of the human genome is composed of human endogenous retroviruses (HERVs), which are thought to be inactive remnants of ancient infections. Previously, we showed that individuals with early HIV-1 infection have stronger anti-HERV T cell responses than uninfected controls. In this study, we investigated whether these responses persist in chronic HIV-1 infection and whether they have a role in the control of HIV-1. Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from 88 subjects diagnosed with HIV-1 infection for at least 1 year (median duration of diagnosis, 13 years) were tested for responses against HERV peptides in gamma interferon (IFN-γ) enzyme immunospot (ELISPOT) assays. Individuals who control HIV-1 viremia without highly active antiretroviral therapy (HAART) had stronger and broader HERV-specific T cell responses than HAART-suppressed patients, virologic noncontrollers, immunologic progressors, and uninfected controls (P < 0.05 for each pairwise comparison). In addition, the magnitude of the anti-HERV T cell response was inversely correlated with HIV-1 viral load (r(2) = 0.197, P = 0.0002) and associated with higher CD4(+) T cell counts (r(2) = 0.072, P = 0.027) in untreated patients. Flow cytometric analyses of an HLA-B51-restricted CD8(+) HERV response in one HIV-1-infected individual revealed a less activated and more differentiated phenotype than that stimulated by a homologous HIV-1 peptide. HLA-B51 tetramer dual staining within this individual confirmed two different T cell populations corresponding to these HERV and HIV-1 epitopes, ruling out cross-reactivity. These findings suggest a possible role for anti-HERV immunity in the control of chronic HIV-1 infection and provide support for a larger effort to design an HIV-1 vaccine that targets conserved antigens such as HERV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,732
Score d'incertitude au seuil0,423

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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