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Enregistrement W2140275500 · doi:10.1046/j.1365-3059.2000.00450.x

Random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis of <i>Phytophthora infestans</i> isolates collected in Canada during 1994 to 1996

2000· article· en· W2140275500 sur OpenAlexaffabout
George Mahuku, R. D. Peters, H. W. Platt, Fouad Daayf

Notice bibliographique

RevuePlant Pathology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesDirectorate for Biological Sciences
Mots-clésPhytophthora infestansBiologyMetalaxylRAPDMating typeGenetic diversityPopulationGeneticsGenetic variabilityGenetic variationGenetic markerFungicideBotanyGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mating type, glucose‐6‐phosphate isomerase ( Gpi ) allozyme banding patterns, response to the fungicide metalaxyl and random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to characterize genetic variability among 141 Canadian isolates of Phytophthora infestans collected between 1994 and 1996. Multiple correspondence analysis of RAPD profiles separated isolates into 21 groups that were not correlated to groups defined by mating type, Gpi allozyme banding patterns or response to metalaxyl. Population subdivision analysis showed that 97% of the total genetic variation was found among individuals within populations, compared with 3% among populations. The average similarity coefficient among isolates was 80%. No significant differences in haplotypic diversity were observed among the years under study, but levels of genetic diversity among local populations of P. infestans were high (0.76). All classes of response to the fungicide metalaxyl were observed, with 55% of isolates displaying moderate levels of insensitivity. The high level of genetic diversity detected within populations indicates that migration and sexual recombination probably play important roles in the population biology of P. infestans in Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,908
Score d'incertitude au seuil0,764

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,171
Écart entre enseignants0,164 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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