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Enregistrement W2140634939 · doi:10.1128/jb.00996-08

PilF Is an Outer Membrane Lipoprotein Required for Multimerization and Localization of the<i>Pseudomonas aeruginosa</i>Type IV Pilus Secretin

2008· article· en· W2140634939 sur OpenAlexafffund
Jason Koo, Stephanie Tammam, Shao-Yang Ku, L.M. Sampaleanu, Lori L. Burrows, P. Lynne Howell

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Structural Characterization
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenMcMaster UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBrookhaven National LaboratoryCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenSick Kids FoundationU.S. Department of Energy
Mots-clésPilusBiologyBacterial outer membraneMutantCell biologySecretin familyCell envelopeBiogenesisSecretinPseudomonas aeruginosaCell membraneMicrobiologyBiochemistryEscherichia coliMembraneSecretionBacteriaGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Type IV pili (T4P) are retractile appendages that contribute to the virulence of bacterial pathogens. PilF is a Pseudomonas aeruginosa lipoprotein that is essential for T4P biogenesis. Phenotypic characterization of a pilF mutant confirmed that T4P-mediated functions are abrogated: T4P were no longer present on the cell surface, twitching motility was abolished, and the mutant was resistant to infection by T4P retraction-dependent bacteriophage. The results of cellular fractionation studies indicated that PilF is the outer membrane pilotin required for the localization and multimerization of the secretin, PilQ. Mutation of the putative PilF lipidation site untethered the protein from the outer membrane, causing secretin assembly in both inner and outer membranes. T4P-mediated twitching motility and bacteriophage susceptibility were moderately decreased in the lipidation site mutant, while cell surface piliation was substantially reduced. The tethering of PilF to the outer membrane promotes the correct localization of PilQ and appears to be required for the formation of stable T4P. Our 2.0-A structure of PilF revealed a superhelical arrangement of six tetratricopeptide protein-protein interaction motifs that may mediate the contacts with PilQ during secretin assembly. An alignment of pseudomonad PilF sequences revealed three highly conserved surfaces that may be involved in PilF function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations114
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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