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Enregistrement W2141022560 · doi:10.1111/ppa.12422

Mapping of clubroot ( <i>Plasmodiophora brassicae</i> ) resistance in canola ( <i>Brassica napus</i> )

2015· article· en· W2141022560 sur OpenAlexafffund
H. Zhang, Jie Feng, Sheau‐Fang Hwang, Stephen E. Strelkov, I. Falak, Xiao‐Chen Huang, Rifei Sun

Notice bibliographique

RevuePlant Pathology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensAgriculture Food and Rural DevelopmentUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesIndustry CanadaCanola Council of CanadaAlberta Crop Industry Development Fund
Mots-clésClubrootBiologyCanolaDoubled haploidyGeneticsBrassicaPopulationGenotypeLocus (genetics)BrassicaceaeBrassica rapaGeneAmpliconBotanyPloidyPolymerase chain reaction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clubroot disease, caused by Plasmodiophora brassicae , has become a major problem in the production of cruciferous crops worldwide. In this study, a population of 121 doubled haploid ( DH ) lines derived from a crossing between a resistant and a susceptible canola ( Brassica napus ) genotype was subjected to phenotypic and genotypic studies to determine the inheritance and location of the resistance gene(s). After inoculation with pathotype 3 of P. brassicae , the lines showed a 1:1 segregation ratio for resistance, indicating that resistance in this population is controlled by a single gene. Fifteen PCR ‐based markers that were known to be linked to clubroot resistance (CR) genes were screened against genomic DNA from parents and resistant and susceptible bulks. Marker GC1680, linked to the CR gene CRa , exhibited polymorphism between the parents and between the resistant and susceptible bulks. CRa target primers were used to amplify fragments from the two parents and the resultant sequences were compared. A high degree of sequence similarity was found between the parents in the nucleotide binding site domain of CRa . In contrast, sequence polymorphisms were detected in the leucine‐rich repeat ( LRR ) domain. One pair of primers that amplify a band from the LRR region of the resistant parent but not the susceptible parent was used to screen the DH population. Amplicons were obtained from 60 of the 61 resistant lines and two of the 60 susceptible lines; thus, three recombinants were found. Based on these results, a resistance locus linked to CRa was found.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,852
Score d'incertitude au seuil0,304

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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