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Enregistrement W2141482343 · doi:10.1128/iai.03123-14

Selection for a CEACAM Receptor-Specific Binding Phenotype during Neisseria gonorrhoeae Infection of the Human Genital Tract

2015· article· en· W2141482343 sur OpenAlexafffund
Anna Sintsova, Henry Wong, Kelly S. MacDonald, Rupert Kaul, Mumtaz Virji, Scott D. Gray‐Owen

Notice bibliographique

RevueInfection and Immunity · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNeisseria gonorrhoeaeBiologyBacterial adhesinPathogenMicrobiologyImmunologyPhenotypeContext (archaeology)Chlamydia trachomatisSexually transmitted diseaseNeisseriaceaeInnate immune systemImmune systemVirulenceAntibioticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infections by Neisseria gonorrhoeae are increasingly common, are often caused by antibiotic-resistant strains, and can result in serious and lasting sequelae, prompting the reemergence of gonococcal disease as a leading global health concern. N. gonorrhoeae is a human-restricted pathogen that primarily colonizes urogenital mucosal surfaces. Disease progression varies greatly between the sexes: men usually present with symptomatic infection characterized by a painful purulent urethral discharge, while in women, the infection is often asymptomatic, with the most severe pathology occurring when the bacteria ascend from the lower genital tract into the uterus and fallopian tubes. Classical clinical studies demonstrated that clinically infectious strains uniformly express Opa adhesins; however, their specificities were unknown at the time. While in vitro studies have since identified CEACAM proteins as the primary target of Opa proteins, the gonococcal specificity for this human family of receptors has not been addressed in the context of natural infection. In this study, we characterize a collection of low-passage-number clinical-specimen-derived N. gonorrhoeae isolates for Opa expression and assess their CEACAM-binding profiles. We report marked in vivo selection for expression of phase-variable Opa proteins that bind CEACAM1 and CEACAM5 but selection against expression of Opa variants that bind to the neutrophil-restricted decoy receptor CEACAM3. This is the first study showing phenotypic selection for distinct CEACAM-binding phenotypes in vivo, and it supports the opposing functions of CEACAMs that facilitate infection versus driving inflammation within the genital tract.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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