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Enregistrement W2141911197 · doi:10.1128/jb.00191-07

Functional Incorporation of Chimeric <i>b</i> Subunits into F <sub>1</sub> F <sub>o</sub> ATP Synthase

2007· article· en· W2141911197 sur OpenAlexaff
Shane B. Claggett, Tammy Bohannon Grabar, Stanley D. Dunn, Brian Cain

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueATP Synthase and ATPases Research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésProtein subunitATP synthaseBiologyEscherichia coliATP synthase gamma subunitGeneRecombinant DNAMolecular biologyBiochemistryATPaseEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

F(1)F(o) ATP synthases function by a rotary mechanism. The enzyme's peripheral stalk serves as the stator that holds the F(1) sector and its catalytic sites against the movement of the rotor. In Escherichia coli, the peripheral stalk is a homodimer of identical b subunits, but photosynthetic bacteria have open reading frames for two different b-like subunits thought to form heterodimeric b/b' peripheral stalks. Chimeric b subunit genes have been constructed by substituting sequence from the Thermosynechococcus elongatus b and b' genes in the E. coli uncF gene, encoding the b subunit. The recombinant genes were expressed alone and in combination in the E. coli deletion strain KM2 (Deltab). Although not all of the chimeric subunits were incorporated into F(1)F(o) ATP synthase complexes, plasmids expressing either chimeric b(E39-I86) or b'(E39-I86) were capable of functionally complementing strain KM2 (Deltab). Strains expressing these subunits grew better than cells with smaller chimeric segments, such as those expressing the b'(E39-D53) or b(L54-I86) subunit, indicating intragenic suppression. In general, the chimeric subunits modeled on the T. elongatus b subunit proved to be more stable than the b' subunit in vitro. Coexpression of the b(E39-I86) and b'(E39-I86) subunits in strain KM2 (Deltab) yielded F(1)F(o) complexes containing heterodimeric peripheral stalks composed of both subunits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,859

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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