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Enregistrement W2142138762 · doi:10.1074/jbc.m212855200

A Ligand-induced Conformational Change in Apolipoprotein(a) Enhances Covalent Lp(a) Formation

2003· article· en· W2142138762 sur OpenAlexaff
Lev Becker, Bradley A. Webb, Seth Chitayat, Michael E. Nesheim, Marlys L. Koschinsky

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCovalent bondChemistryConformational changeApolipoprotein BBiophysicsLipoproteinLigand (biochemistry)Lipoprotein(a)StereochemistryCrystallographyBiochemistryCholesterolReceptorBiologyOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lipoprotein(a) (Lp(a)) assembly proceeds via a two-step mechanism in which initial non-covalent interactions between apolipoprotein(a) (apo(a)) and low density lipoprotein precede disulfide bond formation. In this study, we used analytical ultracentrifugation, differential scanning calorimetry, and intrinsic fluorescence to demonstrate that in the presence of the lysine analog epsilon-aminocaproic acid, apo(a) undergoes a substantial conformational change from a "closed" to an "open" structure that is characterized by an increase in the hydrodynamic radius (approximately 10%), an alteration in domain stability, as well as a decrease in tryptophan fluorescence. Although epsilon-aminocaproic acid is a well characterized inhibitor of the non-covalent interaction between apo(a) and low density lipoprotein, we report the novel observation that this ligand at low concentrations (100 microm-1 mm) significantly enhances covalent Lp(a) assembly by altering the conformation of apo(a). We developed a model for the kinetics of Lp(a) assembly that incorporates the conformational change as a determinant of the efficiency of the process; this model quantitatively explains our experimental observations. Interestingly, an analogous conformational change has been previously described for plasminogen resulting in an increase in the hydrodynamic radius, an increase in tryptophan fluorescence, and an acceleration of the rate of plasminogen activation. Although the functions of apo(a) and plasminogen have diverged considerably, elements of structural and conformational homology have been retained leading to similar regulation of two unrelated biological processes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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