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Enregistrement W2142636101 · doi:10.1086/520595

Mapping of a Region of Ebola Virus VP40 That Is Important in the Production of Virus‐Like Particles

2007· article· en· W2142636101 sur OpenAlexfundno aff
Seiya Yamayoshi, Yoshihiro Kawaoka

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCore Research for Evolutional Science and TechnologyNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesJapan Science and Technology AgencyCanadian Institutes of Health ResearchPublic Health Agency of CanadaNational Institutes of HealthPublic Health Agency
Mots-clésVP40Ebola virusTSG101VirusBiologyAmino acidFiloviridaeVirologyBuddingMarburg virusMutantCell biologyGeneticsGeneViral disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ebola virus VP40 contains 2 overlapping late domains (7-PTAP-10 and 10-PPEY-13) that are essential for its interaction with Tsg101 and Nedd4 in the promotion of viral egress.Deletion of the late domains inhibits VP40-induced virus-like particles (VLPs).However, a truncated form of VP40, which lacks a late domain because of the deletion of amino acids 1-30, is released into supernatant as a VLP, indicating that the remaining portion of VP40 contains the structural elements required for VLP release.Thus, the purpose of this study was to identify the VP40 sequence essential for VLP budding, through the generation of deletion and alaninescanning mutants.We found that the amino acid sequence around the proline at position 53 plays a critical role in VLP production and intracellular transport.These data also may suggest that a novel host factor(s) is involved in virus budding.Ebola virus (EBOV) and Marburg virus comprise the family Filoviridae in the order Mononegavirales.These viruses cause highly lethal hemorrhagic fever with extremely high mortality rates among humans and nonhuman primates [1,2].EBOV has a nonsegmented, negative-stranded RNA genome that encodes 7 structural proteins [1,3].VP40 is the major matrix protein and is essential for virus assembly and release from host cells [4][5][6][7][8].During assembly, VP40 interacts with nucleoprotein to form, together with VP35 and VP24, nucleocapsid-like structures.These nucleocapsid-like Potential conflicts of interest: none reported.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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